26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31414 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_31414  GATA-family of DNA binding proteins-like protein  100 
 
 
316 aa  652    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.987813  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32587  GATA-family of DNA binding protein-like protein  60.66 
 
 
379 aa  93.6  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.527498  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80055  GATA-family DNA binding protein  51.61 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.440121  normal  0.0807232 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03152  DNA binding protein NsdDNsdDPutative uncharacterized protein ;; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92226]  56.86 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.299988 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03435  GATA-factor [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7ZA36]  57.89 
 
 
837 aa  60.1  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.310555 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06330  hypothetical protein  69.7 
 
 
438 aa  59.7  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.529322  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03607  GATA-factorPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7ZA35]  51.28 
 
 
417 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01820  transcriptional activator, putative  39.02 
 
 
1290 aa  56.2  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203708  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32750  predicted protein  58.82 
 
 
395 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0354325  normal  0.0359736 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14167  predicted protein  48.94 
 
 
740 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105859  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15409  predicted protein  52.94 
 
 
243 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29072  zinc finger transcription factor  46.34 
 
 
605 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.965221  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01220  conserved hypothetical protein  56.25 
 
 
392 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66895  regulates glutamine-repressible gene products  42.59 
 
 
782 aa  50.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.414354  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28094  activator of transcription of nitrogen-regulated genes  41.07 
 
 
820 aa  49.7  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08667  Nitrogen regulatory protein areA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P17429]  34.12 
 
 
876 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.219501 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_93136  predicted protein  56.25 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.103901  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32466  predicted protein  45.65 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.440224  normal  0.220937 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00390  hypothetical protein  45 
 
 
514 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01820  hypothetical protein  47.06 
 
 
632 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30438  predicted protein  50 
 
 
209 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.358749  normal  0.0819034 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00176  Putative uncharacterized proteinSiderophore biosynthesis repressor SREA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y754]  58.62 
 
 
549 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30840  GATA type transcriptional activator of nitrogen-regulated genes  53.33 
 
 
486 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06221  GATA factor AREB alphaPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HEV2]  41.94 
 
 
312 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.287011  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25644  predicted protein  58.62 
 
 
385 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.10622 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02140  hypothetical protein  46.88 
 
 
1065 aa  42.7  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>