More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31323 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_31323  mitochondrial RNA helicase  100 
 
 
593 aa  1216    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06149  ATP-dependent RNA helicase mrh4, mitochondrial Precursor (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZY1]  28.74 
 
 
630 aa  184  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0017013  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.25 
 
 
482 aa  120  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.06 
 
 
521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.2 
 
 
505 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.17 
 
 
464 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.536242  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.72 
 
 
465 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.74 
 
 
472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  29.82 
 
 
503 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1773  DEAD/DEAH box helicase-like  29.02 
 
 
477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.9 
 
 
678 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.61 
 
 
504 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3974  putative ATP-dependent RNA helicase  28.61 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  28.28 
 
 
516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2431  ATP-dependent RNA helicase  28.61 
 
 
516 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1478  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.94 
 
 
499 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142934  hitchhiker  0.00960181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.88 
 
 
438 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2463  DEAD/DEAH box helicase-like  28.79 
 
 
500 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.37 
 
 
514 aa  108  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.61 
 
 
462 aa  107  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.166251  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31789  predicted protein  27.09 
 
 
436 aa  107  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00179288  normal  0.0182063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.56 
 
 
527 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.68 
 
 
519 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_004310  BR0938  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  27.16 
 
 
482 aa  107  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.556655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.45 
 
 
571 aa  107  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.68 
 
 
519 aa  107  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.87 
 
 
501 aa  107  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1590  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  26.62 
 
 
455 aa  107  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  26.04 
 
 
460 aa  107  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2321  DEAD/DEAH box helicase-like  28.24 
 
 
487 aa  107  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2099  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  26.1 
 
 
427 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  27.04 
 
 
635 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  27.04 
 
 
639 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.98 
 
 
479 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0933  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  26.92 
 
 
482 aa  106  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0074  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.44 
 
 
450 aa  105  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  27.32 
 
 
506 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.56 
 
 
498 aa  106  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.04 
 
 
489 aa  105  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2249  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.71 
 
 
498 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0874  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.03 
 
 
471 aa  105  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3971  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.13 
 
 
444 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160795  normal  0.568065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.09 
 
 
484 aa  104  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.37 
 
 
418 aa  104  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.684859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1657  DEAD/DEAH box helicase  28.5 
 
 
483 aa  103  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0121598  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0709  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  24.73 
 
 
422 aa  103  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.95 
 
 
628 aa  103  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.51 
 
 
484 aa  103  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 
486 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.82 
 
 
487 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.97 
 
 
537 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0565  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  27.85 
 
 
442 aa  103  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2952  DEAD/DEAH box helicase-like protein  23.22 
 
 
419 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0429  putative ATP-dependent RNA helicase 1  25.12 
 
 
418 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1952  DEAD/DEAH box helicase-like  27.13 
 
 
426 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0945  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.75 
 
 
451 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  24.56 
 
 
799 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0902  ATP-dependent RNA helicase RhlB  26.81 
 
 
483 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.169794  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.25 
 
 
484 aa  102  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.57 
 
 
492 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.95 
 
 
439 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.13 
 
 
494 aa  101  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  25.94 
 
 
537 aa  101  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.42 
 
 
504 aa  101  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  27.98 
 
 
495 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1998  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.93 
 
 
444 aa  101  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03359  ATP-dependent RNA helicase  26.92 
 
 
405 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  26.84 
 
 
521 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.42 
 
 
530 aa  100  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000341148  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1017  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  26.46 
 
 
535 aa  100  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  25.77 
 
 
429 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2278  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.78 
 
 
452 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.64228  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.93 
 
 
571 aa  100  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1768  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  26.11 
 
 
405 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2088  putative ATP-dependent RNA helicase 1  24.63 
 
 
453 aa  100  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.936977 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81007  predicted protein  28.09 
 
 
558 aa  100  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.661709  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1418  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  26.61 
 
 
401 aa  100  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1295  ATP-dependent RNA helicase RhlB  27.06 
 
 
480 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0856  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.42 
 
 
503 aa  99.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0104833  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.42 
 
 
555 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.131298 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002096  ATP-dependent RNA helicase RhlB  27.06 
 
 
439 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  24.31 
 
 
622 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  26.07 
 
 
557 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4554  ATP-dependent RNA helicase RhlB  27.06 
 
 
489 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.74 
 
 
570 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  25.93 
 
 
579 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  25.13 
 
 
552 aa  100  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.51 
 
 
482 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4430  ATP-dependent RNA helicase RhlB  27.06 
 
 
480 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.63 
 
 
511 aa  99.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1052  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  26.46 
 
 
535 aa  99  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1253  ATP-dependent RNA helicase RhlB  27.08 
 
 
397 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.71 
 
 
436 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000176231  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  27.2 
 
 
476 aa  99  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.39 
 
 
598 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1497  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  25.85 
 
 
405 aa  99.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.333515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2139  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.13 
 
 
464 aa  99.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.38 
 
 
474 aa  99.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.17 
 
 
747 aa  99  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.71 
 
 
475 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000426275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>