141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44040 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44040  UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase  100 
 
 
812 aa  1687    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.69787  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
3560 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
4489 aa  162  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  31.79 
 
 
568 aa  162  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
1085 aa  156  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
3035 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  31.48 
 
 
492 aa  154  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
1094 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  30.02 
 
 
459 aa  146  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
700 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 
654 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
569 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
740 aa  145  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 
618 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
732 aa  139  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
647 aa  132  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 
570 aa  130  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  27.09 
 
 
560 aa  130  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
660 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
616 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
761 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  30.12 
 
 
452 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 
706 aa  125  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
611 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 
808 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  26.54 
 
 
632 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 
574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  26.52 
 
 
588 aa  115  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  23.81 
 
 
633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  25.74 
 
 
657 aa  111  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 
672 aa  111  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  24.95 
 
 
1221 aa  110  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 
633 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
295 aa  109  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  28.87 
 
 
585 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  26.11 
 
 
657 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 
1106 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  26.2 
 
 
566 aa  107  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
667 aa  107  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
909 aa  107  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
627 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00265  UDP-N-acetylglucosaminyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G03380)  23.26 
 
 
1596 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0115382 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
727 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.51 
 
 
589 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 
750 aa  105  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 
739 aa  101  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  25.69 
 
 
637 aa  101  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
1106 aa  100  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
738 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  22.95 
 
 
630 aa  99.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
750 aa  99.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  21.67 
 
 
745 aa  98.6  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  30.36 
 
 
395 aa  98.2  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
1714 aa  97.4  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
968 aa  96.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.08 
 
 
529 aa  96.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.77 
 
 
589 aa  95.1  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  22.59 
 
 
719 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  24.6 
 
 
821 aa  93.2  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  24.6 
 
 
776 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  24.6 
 
 
776 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  24.6 
 
 
776 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  23.44 
 
 
740 aa  92.8  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 
734 aa  92.8  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
739 aa  92  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.04 
 
 
667 aa  92  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  24.37 
 
 
821 aa  90.9  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
776 aa  90.9  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
733 aa  90.9  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  23.37 
 
 
747 aa  90.5  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
776 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 
632 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  23.78 
 
 
921 aa  87.4  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 
739 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  22.34 
 
 
816 aa  85.1  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  24.55 
 
 
680 aa  85.1  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
590 aa  84.7  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  26.24 
 
 
590 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  23.58 
 
 
624 aa  83.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  23.82 
 
 
797 aa  84  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
708 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 
974 aa  83.2  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 
789 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  23.11 
 
 
699 aa  82.4  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  23.75 
 
 
582 aa  82.4  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  21.87 
 
 
1415 aa  81.3  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  24.66 
 
 
937 aa  81.3  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 
822 aa  80.9  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  23.56 
 
 
708 aa  79.3  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  24.53 
 
 
731 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  24.53 
 
 
731 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 
732 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  23 
 
 
718 aa  78.2  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  24.44 
 
 
2490 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  24.43 
 
 
1143 aa  77.4  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 
828 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
717 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.04 
 
 
740 aa  76.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 
828 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
717 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>