253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_6032 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_6032  predicted protein  100 
 
 		 146 aa  304  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394026  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  56.16 
 
 		 326 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  55.48 
 
 		 319 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  53.79 
 
 		 327 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  51.72 
 
 		 327 aa  141  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  52.05 
 
 		 323 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  54.11 
 
 		 321 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  51.72 
 
 		 323 aa  136  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.41 
 
 		 681 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.34 
 
 		 323 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  51.72 
 
 		 320 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  50.34 
 
 		 323 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  50.34 
 
 		 323 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.97 
 
 		 323 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  50 
 
 		 401 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.97 
 
 		 322 aa  127  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  49.65 
 
 		 323 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  47.59 
 
 		 316 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  47.59 
 
 		 324 aa  123  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  49.66 
 
 		 321 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  44.83 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.48 
 
 		 348 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.48 
 
 		 348 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  46.58 
 
 		 542 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  45.52 
 
 		 595 aa  117  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.14 
 
 		 506 aa  117  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.21 
 
 		 1550 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  40.41 
 
 		 343 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  43.38 
 
 		 694 aa  114  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.9 
 
 		 1965 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  45.89 
 
 		 245 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  43.54 
 
 		 400 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  42.96 
 
 		 314 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.58 
 
 		 680 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.78 
 
 		 1309 aa  111  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  45.21 
 
 		 249 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0812  Stage II sporulation E family protein  43.17 
 
 		 422 aa  110  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10742  predicted protein  48.2 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182467  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  43.15 
 
 		 669 aa  110  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  43.26 
 
 		 441 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  43.26 
 
 		 431 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.78 
 
 		 442 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.47 
 
 		 321 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 		 399 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  42.47 
 
 		 438 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  44.52 
 
 		 253 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  44.83 
 
 		 238 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  44.52 
 
 		 253 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  44.83 
 
 		 249 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  44.83 
 
 		 249 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  42.07 
 
 		 226 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 		 640 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.86 
 
 		 318 aa  107  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 		 662 aa  107  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.14 
 
 		 624 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.78 
 
 		 465 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  39.73 
 
 		 794 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.82 
 
 		 367 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  42.14 
 
 		 497 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  44.52 
 
 		 240 aa  104  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  43.15 
 
 		 398 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  42.47 
 
 		 356 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.07 
 
 		 878 aa  103  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  43.45 
 
 		 267 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  43.45 
 
 		 276 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  47.66 
 
 		 514 aa  103  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  42.86 
 
 		 781 aa  103  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  39.44 
 
 		 417 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4177  hypothetical protein  42.66 
 
 		 344 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.878015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 929 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  44.03 
 
 		 607 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  42.07 
 
 		 732 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.06 
 
 		 780 aa  99.4  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.04 
 
 		 1423 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2109  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40 
 
 		 599 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.74 
 
 		 737 aa  97.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.85 
 
 		 740 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  39.04 
 
 		 1428 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.1 
 
 		 603 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0192  serine/threonine protein kinase  37.24 
 
 		 471 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  42.75 
 
 		 603 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.07 
 
 		 728 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 		 864 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  39.73 
 
 		 325 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.86 
 
 		 722 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.73 
 
 		 326 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2343  putative GAF sensor protein  40 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3138  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.78 
 
 		 345 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03400  two-component sensor molecule, putative  38.89 
 
 		 1617 aa  94.7  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.64378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  40.82 
 
 		 743 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1877  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.86 
 
 		 722 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4543  GAF domain/GGDEF domain/EAL domain protein  39.46 
 
 		 607 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38768  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  41.78 
 
 		 406 aa  93.2  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0329  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.26 
 
 		 336 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.832493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  36.99 
 
 		 363 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1974  diguanylate cyclase  41.26 
 
 		 336 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1125 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2011  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.62 
 
 		 321 aa  90.5  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0323841  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44514  light histidine kinase  40.71 
 
 		 850 aa  90.5  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04157  histidine kinase-response regulator hybrid protein  36.36 
 
 		 306 aa  90.5  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.851557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>