32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49881 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_49881  predicted protein  100 
 
 
423 aa  863    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  25.2 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  25 
 
 
312 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  23.35 
 
 
341 aa  62.4  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  26.79 
 
 
1557 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  24.47 
 
 
990 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  23.84 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  24.46 
 
 
1762 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  21.54 
 
 
326 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  26.84 
 
 
993 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  24.89 
 
 
812 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  26.56 
 
 
321 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  26.53 
 
 
430 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  26.27 
 
 
1009 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  26.27 
 
 
1009 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  26.27 
 
 
1017 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 
508 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  23.96 
 
 
445 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  27.83 
 
 
317 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  25.52 
 
 
667 aa  47.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  27.32 
 
 
776 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  26.72 
 
 
368 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  21.68 
 
 
461 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  25.3 
 
 
471 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  24.12 
 
 
1656 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  26.56 
 
 
321 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  26.18 
 
 
336 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  25.68 
 
 
693 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
454 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  29.41 
 
 
1407 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3941  hypothetical protein  31.3 
 
 
781 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 
795 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>