50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47601 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47601  predicted protein  100 
 
 		 404 aa  813    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  37.46 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  37.46 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  32.72 
 
 		 313 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  35.9 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0726  tocopherol phytyltransferase  32.62 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00119936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  32.9 
 
 		 318 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3881  tocopherol phytyltransferase  32.47 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.630797  decreased coverage  0.00732369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0386  tocopherol phytyltransferase  35.5 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000735368  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119481  homogentisate phytylprenyltransferase/homogentisic acid geranylgeranyl transferase  30.41 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18364  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32069  predicted protein  32.26 
 
 		 319 aa  127  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2738  predicted protein  34.33 
 
 		 235 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  25.93 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.61 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  26.7 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  27.32 
 
 		 343 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  24.06 
 
 		 335 aa  53.5  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.8 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  25.26 
 
 		 334 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1866  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.23 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1892  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.23 
 
 		 326 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0278945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  25.4 
 
 		 333 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3844  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.32 
 
 		 340 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16384  predicted protein  22.83 
 
 		 317 aa  50.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.960686  normal  0.418422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.95 
 
 		 326 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  24.87 
 
 		 333 aa  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.59 
 
 		 339 aa  49.7  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  24.87 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.82 
 
 		 295 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.98 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  27.23 
 
 		 338 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  25.26 
 
 		 336 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.24 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.07 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  28.41 
 
 		 281 aa  47.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2065  UbiA prenyltransferase  33.76 
 
 		 245 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.05 
 
 		 317 aa  47  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.01 
 
 		 274 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.32 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  22.51 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  26.18 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.8 
 
 		 315 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0941  bacteriochlorophyll c synthase  26.78 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.26 
 
 		 315 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.26 
 
 		 315 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  25.62 
 
 		 296 aa  43.5  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  27.8 
 
 		 279 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20661  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.78 
 
 		 336 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1852  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.06 
 
 		 294 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409299 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.27 
 
 		 376 aa  43.1  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>