10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46518 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46518  predicted protein  100 
 
 
1081 aa  2206    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42154  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46405  predicted protein  43.86 
 
 
813 aa  54.3  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47657  predicted protein  40.85 
 
 
583 aa  48.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47260  predicted protein  40 
 
 
398 aa  48.1  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.776237  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  38.04 
 
 
1000 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  37.89 
 
 
590 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  35.34 
 
 
1096 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  27.56 
 
 
840 aa  45.8  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33106  predicted protein  29.67 
 
 
657 aa  45.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  29.63 
 
 
504 aa  45.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>