35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45413 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45413  predicted protein  100 
 
 
175 aa  365  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000791095  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5105  hypothetical protein  51.01 
 
 
160 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0979763  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5198  hypothetical protein  50.34 
 
 
160 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5258  hypothetical protein  51.01 
 
 
160 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1327  hypothetical protein  49.66 
 
 
162 aa  141  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5023  hypothetical protein  49.66 
 
 
160 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0956  hypothetical protein  47.59 
 
 
141 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5965  hypothetical protein  44.87 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5432  hypothetical protein  46.79 
 
 
161 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68970  hypothetical protein  45.51 
 
 
160 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2166  hypothetical protein  44.16 
 
 
184 aa  137  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1855  hypothetical protein  42.57 
 
 
164 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790822  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01871  lipoprotein, putative  41.26 
 
 
223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2917  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  114  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.389629  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01340  hypothetical protein  37.06 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0513  hypothetical protein  40.56 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00777462  normal  0.634393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3579  hypothetical protein  41.33 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004125  hypothetical protein  36.36 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000493845  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1255  hypothetical protein  38.67 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.641108  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3511  hypothetical protein  40.54 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1802  hypothetical protein  38.79 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2397  hypothetical protein  36.05 
 
 
152 aa  107  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2058  hypothetical protein  36.91 
 
 
165 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2318  hypothetical protein  37.67 
 
 
185 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701978  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1465  hypothetical protein  40.28 
 
 
156 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1551  hypothetical protein  36.42 
 
 
171 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147627  hitchhiker  0.00645173 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2015  hypothetical protein  37.67 
 
 
185 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179761  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0834  hypothetical protein  32.24 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1689  hypothetical protein  32.87 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000692743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00290  hypothetical protein  36.67 
 
 
176 aa  95.1  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0975  hypothetical protein  34.67 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.149641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0090  hypothetical protein  36.49 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2158  translation elongation factor P (EF-P)  27.22 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401757  normal  0.635134 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
131 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  33.72 
 
 
144 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>