12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44831 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44831  predicted protein  100 
 
 
747 aa  1554    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2661  hypothetical protein  36.69 
 
 
513 aa  317  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.322839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1105  hypothetical protein  37.33 
 
 
480 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.904271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2403  hypothetical protein  37.42 
 
 
480 aa  294  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000299898  hitchhiker  0.00038585 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46586  predicted protein  32.7 
 
 
514 aa  227  5.0000000000000005e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13214  predicted protein  35.04 
 
 
227 aa  97.4  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.197613  normal  0.610891 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29682  predicted protein  35.04 
 
 
227 aa  97.4  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0651276  decreased coverage  0.000212127 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56836  predicted protein  29.17 
 
 
215 aa  89.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.684824  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57597  predicted protein  29.71 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.70562  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05000  hypothetical membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09890)  34.59 
 
 
214 aa  73.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210733  normal  0.138973 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00730  conserved hypothetical protein  37.01 
 
 
297 aa  65.1  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87349  predicted protein  30.05 
 
 
215 aa  58.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.389115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>