11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43234 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43234  predicted protein  100 
 
 		 267 aa  556  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43233  predicted protein  49.41 
 
 		 517 aa  260  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.479677  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32401  predicted protein  48.63 
 
 		 545 aa  255  5e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114627  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43232  predicted protein  48.63 
 
 		 568 aa  254  8e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4839  hypothetical protein  26.34 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4605  hypothetical protein  26.1 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711362  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33242  Conserved hypothetical protein  26.92 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.50965  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2477  hypothetical protein  32.61 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000753465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1785  low-co2 inducible protein lcib  28.51 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0330  LCIC; low-CO2 inducible protein  27.64 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0323  low-co2 inducible protein lcib  27.27 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>