15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42504 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42504  predicted protein  100 
 
 
448 aa  935    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46157  predicted protein  29.46 
 
 
565 aa  192  8e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04997  putative phosphatidylinositol transporter (Eurofung)  27.11 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85298  predicted protein  25.26 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239178  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45868  predicted protein  22.16 
 
 
475 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30692  predicted protein  31.4 
 
 
733 aa  57.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.371781  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6256  predicted protein  22.79 
 
 
195 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0566773  normal  0.813084 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00243  phosphatidylinositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09260)  22.76 
 
 
444 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  unclonable  0.000000000000350361  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00270  sec14 cytosolic factor, putative  28.12 
 
 
226 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04130  sec14 cytosolic factor, putative  28.12 
 
 
238 aa  54.3  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229103  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00485  CRAL/TRIO domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13930)  27.72 
 
 
471 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00320902  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06809  CRAL/TRIO domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G00680)  32.86 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.388007 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28205  predicted protein  21.39 
 
 
667 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92718  predicted protein  22.7 
 
 
280 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648884  normal  0.0265803 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13731  predicted protein  23.36 
 
 
310 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>