More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12243 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_12243  predicted protein  100 
 
 
137 aa  287  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00787486  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2322  peptide methionine sulfoxide reductase  35.97 
 
 
224 aa  88.6  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  32.59 
 
 
168 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  35.37 
 
 
351 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0346  peptide methionine sulfoxide reductase  35.51 
 
 
221 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  36.69 
 
 
397 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  35.25 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  33.58 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  35.34 
 
 
209 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  34.81 
 
 
311 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  31.34 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  34.78 
 
 
290 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  33.33 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  31.97 
 
 
175 aa  80.1  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  33.58 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  31.85 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  37.76 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  33.83 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  31.88 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  34.53 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  33.58 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  32.37 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  33.57 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  32.84 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  33.58 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  31.65 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  33.08 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  32.37 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  32.37 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  34.67 
 
 
155 aa  77  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  33.58 
 
 
169 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  33.58 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  34.78 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  30.61 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  33.58 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  32.86 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  34.53 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0735  Methionine sulfoxide reductase A  38.21 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000498519  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0286  methionine sulfoxide reductase A  32.37 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  30.94 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  34.33 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  31.76 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  32.37 
 
 
416 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  31.34 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  31.65 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  32.33 
 
 
176 aa  73.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  32.85 
 
 
236 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  28.78 
 
 
262 aa  73.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  30.6 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  29.5 
 
 
186 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  31.65 
 
 
197 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  32.09 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  28.89 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13107  predicted protein  31.79 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  30.71 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  34.97 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  32.09 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  31.11 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  31.16 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  33.81 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  30.22 
 
 
191 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  31.82 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  32.09 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  32.17 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  34.06 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  33.83 
 
 
287 aa  72  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  31.34 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  31.58 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  29.05 
 
 
158 aa  72  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  33.33 
 
 
218 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  28.78 
 
 
186 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  33.83 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  30.94 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  31.39 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  36.62 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  28.37 
 
 
178 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  30.2 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  31.88 
 
 
334 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3417  methionine sulfoxide reductase A  34.27 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  33.33 
 
 
181 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  30 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14769  predicted protein  30.71 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  31.91 
 
 
212 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  31.65 
 
 
416 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  31.97 
 
 
220 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  32.39 
 
 
212 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  32.17 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  32.12 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2237  peptide methionine sulfoxide reductase  32.17 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  hitchhiker  0.0000000561998 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  32.39 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  30.83 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  29.85 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  33.09 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  29.85 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  31.34 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  31.16 
 
 
735 aa  71.2  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  31.69 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  31.88 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  32.39 
 
 
212 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  32.39 
 
 
212 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>