12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1480 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1480  conjugative transposon protein TraI  100 
 
 		 209 aa  428  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.886511 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3003  hypothetical protein  53.44 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0937  hypothetical protein  28.49 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947661  normal  0.135237 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4356  hypothetical protein  26.04 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0548417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3544  hypothetical protein  24.85 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0250253  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4354  hypothetical protein  25.78 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0193254  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0938  hypothetical protein  23.36 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0794687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  28.36 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  28.36 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  28.36 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  28.36 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  33.33 
 
 		 241 aa  41.6  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>