296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0695 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0695  immunoreactive 43 kDa antigen PG32  100 
 
 
391 aa  810    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.0000000023123 
 
 
-
 
NC_002950  PG0694  immunoreactive 42 kDa antigen PG33  45.81 
 
 
380 aa  315  9.999999999999999e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.0000000023367 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0318  OmpA/MotB domain protein  28.28 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000964378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  28.16 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  32.18 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  32.18 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  36.64 
 
 
244 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  43.53 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  38.05 
 
 
344 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  38.05 
 
 
344 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  38.05 
 
 
344 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.04 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  38.1 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
401 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  28.16 
 
 
356 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2499  hypothetical protein  40.48 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.33 
 
 
447 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  34.21 
 
 
429 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  57.4  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  33.04 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  38.14 
 
 
228 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  32.81 
 
 
352 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 
228 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  36.17 
 
 
358 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.51 
 
 
344 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  37.29 
 
 
228 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.74 
 
 
337 aa  57  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1558  OmpA/MotB domain protein  27.11 
 
 
397 aa  56.2  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0671389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  27.52 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  36.96 
 
 
210 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  30.7 
 
 
365 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  33.04 
 
 
337 aa  53.9  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  26.13 
 
 
394 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  24.86 
 
 
392 aa  53.5  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 
376 aa  53.5  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 
477 aa  53.1  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  34.04 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  34.04 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  39.51 
 
 
278 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  34.04 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  34.04 
 
 
358 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  34.04 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  34.04 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  34.04 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  34.04 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  34.04 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  36.73 
 
 
366 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  38.89 
 
 
212 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1230  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 
1124 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172002  decreased coverage  0.00819992 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  24.36 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  33.64 
 
 
327 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  36.08 
 
 
210 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  36.08 
 
 
210 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  32.98 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  38.27 
 
 
201 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  32.98 
 
 
358 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  32.98 
 
 
358 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 
234 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260064  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  32.98 
 
 
369 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  32.98 
 
 
369 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3921  OmpA/MotB  32.67 
 
 
274 aa  50.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  31.13 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  31.13 
 
 
366 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2713  OmpA/MotB  31.4 
 
 
175 aa  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.202213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  30.6 
 
 
376 aa  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  35.58 
 
 
226 aa  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  39.22 
 
 
294 aa  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  29.6 
 
 
375 aa  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.65 
 
 
163 aa  49.7  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5131  OmpA/MotB domain protein  32.38 
 
 
170 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1528  OmpA domain-containing protein  30.19 
 
 
180 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000113524  normal  0.565826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  32.98 
 
 
351 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 
166 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  30.28 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  35.8 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  33.8 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4277  OmpA/MotB domain-containing protein  45.9 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.48369  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  31.43 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  32.29 
 
 
220 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  35.44 
 
 
445 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  37.63 
 
 
232 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.89 
 
 
242 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  33.33 
 
 
261 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  33.33 
 
 
261 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  37.23 
 
 
230 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.37 
 
 
219 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  38.75 
 
 
264 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  37.36 
 
 
231 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 
200 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  34.41 
 
 
225 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  37.04 
 
 
273 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  37.23 
 
 
230 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08396  OmpA/MotB  34.65 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  29.2 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  32.61 
 
 
355 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  28.26 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  38.82 
 
 
219 aa  47.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  26.21 
 
 
201 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>