26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4498 on replicon NC_011721
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011721  PCC8801_4498  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  173  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  46.43 
 
 		 3193 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  36.49 
 
 		 2003 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  32.43 
 
 		 1558 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  31.17 
 
 		 1602 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  43.1 
 
 		 1583 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  28.92 
 
 		 1586 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  44.64 
 
 		 2277 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  44 
 
 		 2138 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  41.38 
 
 		 1604 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  43.86 
 
 		 1840 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  43.86 
 
 		 1917 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  37.5 
 
 		 1379 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  43.86 
 
 		 1669 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  48 
 
 		 2178 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  38.6 
 
 		 1446 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  36.84 
 
 		 2035 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  40.35 
 
 		 1421 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  42.11 
 
 		 1942 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  32.39 
 
 		 1271 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  35.85 
 
 		 1381 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1620 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  30.26 
 
 		 3073 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6263  YD repeat-containing protein  35.71 
 
 		 939 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2470  rhs-related protein  39.29 
 
 		 890 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  38.18 
 
 		 1568 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>