More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2088 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2088  histidine kinase  100 
 
 
857 aa  1755    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2132  histidine kinase  100 
 
 
857 aa  1755    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
1322 aa  333  6e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
1058 aa  333  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
1090 aa  327  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
1090 aa  327  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
1578 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
844 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
844 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
1611 aa  317  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 
1285 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 
1068 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  34.01 
 
 
810 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
1002 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
1002 aa  294  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 
1099 aa  290  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
1002 aa  289  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  35.42 
 
 
800 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
1672 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
747 aa  247  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  30.75 
 
 
2051 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 
939 aa  219  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
720 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
1323 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  32.7 
 
 
1323 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  32.16 
 
 
1257 aa  209  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
675 aa  209  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
841 aa  207  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
989 aa  207  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 
784 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 
770 aa  205  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0133  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
766 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 
750 aa  203  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.86 
 
 
922 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
1120 aa  201  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
721 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
989 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 
865 aa  197  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 
1146 aa  197  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 
1126 aa  193  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
1362 aa  192  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
1195 aa  192  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 
1178 aa  192  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 
811 aa  191  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 
935 aa  191  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  31.7 
 
 
1153 aa  191  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.46 
 
 
1057 aa  190  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
1130 aa  190  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
1128 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
1175 aa  189  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 
1127 aa  188  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  27.62 
 
 
781 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 
807 aa  187  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  28.27 
 
 
1128 aa  187  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 
882 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.36 
 
 
1131 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1691 aa  186  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
801 aa  186  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  30.42 
 
 
1121 aa  185  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  29.21 
 
 
1125 aa  184  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
1078 aa  184  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
1202 aa  184  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 
1127 aa  184  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
1197 aa  183  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 
937 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 
1173 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  28.99 
 
 
1211 aa  182  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 
1197 aa  182  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  29.57 
 
 
755 aa  177  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  32.23 
 
 
497 aa  177  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
817 aa  177  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  28.63 
 
 
1166 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
970 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
1550 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
1068 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
957 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 
945 aa  176  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
791 aa  176  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
1075 aa  176  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  29.45 
 
 
1560 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 
1113 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.62 
 
 
763 aa  174  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1627  histidine kinase  32.34 
 
 
538 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
968 aa  174  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  27.1 
 
 
1124 aa  174  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 
737 aa  173  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  31.23 
 
 
984 aa  173  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
1199 aa  173  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  31.54 
 
 
742 aa  173  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 
781 aa  172  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 
932 aa  172  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  31.51 
 
 
725 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.25 
 
 
929 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  29.68 
 
 
1161 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 
1122 aa  172  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
631 aa  172  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  27.62 
 
 
803 aa  171  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  30.56 
 
 
588 aa  171  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
785 aa  171  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  31.09 
 
 
1125 aa  170  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>