53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2009 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2034  extracellular solute-binding protein family 1  99.53 
 
 
422 aa  858    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.822994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2009  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
422 aa  862    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3827  extracellular solute-binding protein family 1  52.69 
 
 
419 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  22.3 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2214  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  22.19 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0656001  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2559  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  22.19 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0747  extracellular solute-binding protein  20.5 
 
 
435 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3624  extracellular solute-binding protein family 1  20.36 
 
 
425 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541774  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 
411 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4463  extracellular solute-binding protein  20.61 
 
 
411 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00452134  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4429  extracellular solute-binding protein  20.45 
 
 
430 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 
429 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.78 
 
 
431 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 
414 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  20.5 
 
 
439 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.73 
 
 
407 aa  53.9  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
433 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 
411 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.35 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  21.46 
 
 
437 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08401  hypothetical protein  22.86 
 
 
427 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  19.88 
 
 
418 aa  49.7  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 
415 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 
401 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 
455 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
410 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.68 
 
 
411 aa  47  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  21.33 
 
 
398 aa  47  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  21.21 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 
419 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 
449 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
457 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  21.21 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
391 aa  44.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0234  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  20.25 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.500336 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  20.62 
 
 
415 aa  44.3  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 
449 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  20.75 
 
 
413 aa  43.9  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  20.42 
 
 
460 aa  43.9  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  20.91 
 
 
454 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21.75 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  21.02 
 
 
400 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
391 aa  43.1  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1807  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 
402 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 
407 aa  43.1  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 
428 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 
412 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
412 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>