19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4796 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4796  protein of unknown function DUF101  100 
 
 
140 aa  283  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  35.71 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  33.09 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  31.91 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  31.91 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  31.88 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  33.33 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  31.34 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  30.34 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  31.91 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  25.93 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  27.03 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  27.61 
 
 
136 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0987  hypothetical protein  27.21 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  27.01 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  28.47 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  27.14 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  29.79 
 
 
138 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1019  protein of unknown function DUF101  25.53 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>