13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2667 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2667  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  289  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2500  hypothetical protein  29.37 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483165  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1727  hypothetical protein  27.45 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0931022  normal  0.136922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2256  putative signal peptide protein  27.36 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2435  hypothetical protein  26.83 
 
 
153 aa  52  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2461  putative signal peptide protein  26.42 
 
 
192 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2068  putative signal peptide protein  26.42 
 
 
192 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0536236  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4753  hypothetical protein  30.28 
 
 
224 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4035  hypothetical protein  29.31 
 
 
214 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1125  hypothetical protein  19.85 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.182656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3750  hypothetical protein  21.71 
 
 
183 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1408  hypothetical protein  30.77 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100855  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2834  hypothetical protein  23.08 
 
 
148 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318631  normal  0.450253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>