15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2102 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2102  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000872957 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3402  hypothetical protein  65 
 
 
87 aa  117  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1241  hypothetical protein  56.79 
 
 
83 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1271  hypothetical protein  56.79 
 
 
83 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00344296  hitchhiker  0.00936719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0454  hypothetical protein  63.51 
 
 
91 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.28328  normal  0.117172 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3366  hypothetical protein  58.44 
 
 
87 aa  103  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504831  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  39.47 
 
 
552 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
1448 aa  52  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
994 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  34.25 
 
 
1219 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  39.68 
 
 
1507 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
1544 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 
1321 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
1247 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
1621 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>