32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3425 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3425  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  275  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3583  Protein of unknown function DUF2502  95.71 
 
 		 140 aa  242  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000921365  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1328  hypothetical protein  49.46 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0457315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1440  hypothetical protein  49.46 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.591275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3414  hypothetical protein  58.7 
 
 		 133 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.824951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1719  hypothetical protein  41.75 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00113382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2617  hypothetical protein  41.75 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.597605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1827  hypothetical protein  41.75 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2733  hypothetical protein  59.68 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.504136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2925  hypothetical protein  38.61 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2681  hypothetical protein  38.38 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146587  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02300  hypothetical protein  38.38 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02261  hypothetical protein  38.38 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3622  hypothetical protein  38.38 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.669652  normal  0.697764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2759  hypothetical protein  38.38 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2542  hypothetical protein  38.38 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1279  hypothetical protein  38.38 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.887196  normal  0.128459 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1267  conserved hypothetical protein  38.38 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.389303  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3591  conserved hypothetical protein  43.86 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3650  hypothetical protein  43.86 
 
 		 98 aa  57  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0567  hypothetical protein  36.28 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00005  hypothetical protein  43.86 
 
 		 98 aa  57  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00005  hypothetical protein  43.86 
 
 		 98 aa  57  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0006  hypothetical protein  43.86 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0736332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0781  hypothetical protein  44.78 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2599  hypothetical protein  42.67 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2665  hypothetical protein  42.67 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2641  hypothetical protein  42.67 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2550  hypothetical protein  42.67 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2771  hypothetical protein  42.67 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.466623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2726  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00442656  normal  0.0144375 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0811  hypothetical protein  39.13 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0270674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>