178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2975 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2975  Glutathione transferase  100 
 
 		 319 aa  664    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341476  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1305  Glutathione transferase  92.16 
 
 		 319 aa  623  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2708  Glutathione transferase  73.25 
 
 		 320 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1200  Glutathione transferase  71.97 
 
 		 320 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2185  putative glutathione S-transferase  54.71 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01866  predicted glutathione S-transferase  53.12 
 
 		 320 aa  343  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316571  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1137  glutathione S-transferase-like protein  54.6 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.356258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3998  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.03 
 
 		 325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721034  hitchhiker  0.00627186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3580  fructose-bisphosphate aldolase  52.1 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1835  glutathione S-transferase-like protein  55.52 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000726325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3603  hypothetical protein  54.4 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3402  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.95 
 
 		 318 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.291765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3062  Glutathione transferase  54.29 
 
 		 336 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.795635  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2361  hypothetical protein  51.55 
 
 		 319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3343  glutathione S-transferase domain protein  52.15 
 
 		 332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2507  hypothetical protein  51.55 
 
 		 319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0614  hypothetical protein  52.65 
 
 		 315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2008  glutathione S-transferase-like protein  52.5 
 
 		 319 aa  335  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002964  predicted glutathione S-transferase  53.44 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2798  putative glutathione S-transferase protein  54.41 
 
 		 328 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.830078  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1604  putative glutathione S-transferase  52.42 
 
 		 328 aa  332  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2281  putative glutathione S-transferase  53.64 
 
 		 330 aa  332  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806368  normal  0.334105 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02944  glutathione S-transferase  52.04 
 
 		 314 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3241  hypothetical protein  53.7 
 
 		 322 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3173  glutathione S-transferase  52.6 
 
 		 332 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00834224  normal  0.305106 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2583  putative glutathione S-transferase  53.54 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378441  hitchhiker  0.0000439857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2382  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.6 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200845  hitchhiker  0.00582384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2220  putative glutathione S-transferase  52.84 
 
 		 333 aa  325  7e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1579  IMP dehydrogenase/GMP reductase  51.4 
 
 		 320 aa  323  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.39795  normal  0.554537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2137  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.97 
 
 		 339 aa  322  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000359074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4275  glutathione S-transferase-like protein  49.38 
 
 		 321 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0853  putative glutathione S-transferase  51.06 
 
 		 328 aa  322  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2323  Glutathione transferase  52.01 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.131425 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1060  glutathione S-transferase-like protein  51.06 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0432833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0702  putative glutathione S-transferase  50 
 
 		 327 aa  320  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1201  putative IMP dehydrogenase/GMP reductase  49.38 
 
 		 323 aa  318  6e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1276  glutathione S-transferase-like protein  51.56 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.248613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3495  putative glutathione S-transferase  50.47 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0491711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4679  glutathione S-transferase  49.85 
 
 		 328 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0018476  normal  0.811499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1723  putative glutathione S-transferase  50.15 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.959435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30350  hypothetical protein  50.47 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5405  Glutathione transferase  52.48 
 
 		 314 aa  314  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2451  glutathione S-transferase-like protein  49.39 
 
 		 328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1509  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.15 
 
 		 327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2598  hypothetical protein  50.47 
 
 		 324 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1775  hypothetical protein  50 
 
 		 327 aa  311  9e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0157  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.08 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3749  putative glutathione S-transferase domain protein  49.85 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3798  Glutathione transferase  50.15 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0521  putative glutathione S-transferase  50 
 
 		 327 aa  309  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2671  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.07 
 
 		 337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0021828  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1455  glutathione S-transferase  49.85 
 
 		 326 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217896  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1431  Glutathione S-transferase domain  49.54 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.858691 
 
 
-
 
NC_004310  BR1561  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.85 
 
 		 327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0169  putative glutathione S-transferase  48.92 
 
 		 329 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1656  glutathione S-transferase-like protein  51.47 
 
 		 328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0858873  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0800  glutathione S-transferase family protein  49.69 
 
 		 318 aa  305  5.0000000000000004e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.170497  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3010  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.24 
 
 		 347 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1173  putative glutathione S-transferase  49.68 
 
 		 327 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0368  putative glutathione S-transferase  48.62 
 
 		 326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1761  putative IMP dehydrogenase/GMP reductase  48.94 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0457126  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2675  glutathione S-transferase  49.21 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2206  glutathione S-transferase domain  50.3 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0374  hypothetical protein  50.16 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.520714  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3520  Glutathione transferase  48.92 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.374322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2276  glutathione S-transferase  50.46 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1116  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.69 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.660957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0479  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.69 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.342726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0543  putative glutathione S-transferase  47.38 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4107  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.7 
 
 		 326 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1469  hypothetical protein  48.02 
 
 		 334 aa  295  7e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4511  glutathione S-transferase-like  47 
 
 		 320 aa  294  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2524  Glutathione S-transferase domain  49.24 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0524835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2004  putative glutathione S-transferase  46.86 
 
 		 325 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3852  putative glutathione S-transferase  48.55 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1732  putative glutathione S-transferase  47.22 
 
 		 324 aa  292  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2450  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.37 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0833  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.85 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0270  glutathione S-transferase-like protein  46.06 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.813177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2249  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.33 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.386562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1210  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.08 
 
 		 323 aa  289  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4602  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.23 
 
 		 328 aa  289  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.957897  normal  0.248638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1068  glutathione S-transferase-like protein  47.54 
 
 		 322 aa  288  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.911478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3394  Glutathione transferase  46.77 
 
 		 326 aa  287  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3122  putative glutathione S-transferase  48.23 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3494  glutathione S-transferase  46.77 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3424  hypothetical protein  46.77 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0452209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3421  hypothetical protein  46.77 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1591  glutathione S-transferase  45.78 
 
 		 333 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0102059  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1170  Glutathione transferase  45.82 
 
 		 334 aa  285  7e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.56227  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0737  Glutathione transferase  44.92 
 
 		 331 aa  285  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1659  glutathione S-transferase-like protein  50.35 
 
 		 335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00459685  normal  0.290842 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2543  glutathione S-transferase  46.89 
 
 		 329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0355299  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3528  glutathione S-transferase  46.77 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0794367 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0652  glutathione S-transferase  46.89 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0242  glutathione S-transferase  45.48 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0519  Glutathione transferase  44.62 
 
 		 331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0599  conserved hypothetical protein  45.85 
 
 		 328 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0654  Glutathione S-transferase domain protein  45.13 
 
 		 312 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.969592 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4417  hypothetical protein  45.54 
 
 		 328 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.243215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>