More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2787 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2787  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  100 
 
 		 257 aa  529  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0212634  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1476  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  99.22 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1379  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  90.27 
 
 		 257 aa  461  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.451284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2565  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  90.66 
 
 		 257 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3323  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  84.82 
 
 		 257 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0414676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0350  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  82.81 
 
 		 265 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00950632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1431  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  82.81 
 
 		 265 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000341956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1541  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  82.81 
 
 		 265 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.920327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2456  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  83.27 
 
 		 257 aa  410  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180291  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2684  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  83.27 
 
 		 257 aa  411  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.186736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2600  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  83.27 
 
 		 257 aa  411  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0142427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2462  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  83.27 
 
 		 257 aa  411  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.460847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3446  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  83.27 
 
 		 257 aa  411  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377985  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02231  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  82.88 
 
 		 257 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.985627  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1350  ABC transporter related protein  82.88 
 
 		 257 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318832  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2492  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  82.49 
 
 		 258 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.793796  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2580  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  82.49 
 
 		 258 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.676694  normal  0.169811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2538  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  82.49 
 
 		 257 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2592  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  82.49 
 
 		 258 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2701  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  82.49 
 
 		 258 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1346  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  82.88 
 
 		 257 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02191  hypothetical protein  82.88 
 
 		 257 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2855  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  80.54 
 
 		 257 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.717759  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.11 
 
 		 255 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.11 
 
 		 255 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  68.77 
 
 		 259 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  68.11 
 
 		 255 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  68.11 
 
 		 255 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.11 
 
 		 255 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  68.11 
 
 		 255 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.5 
 
 		 255 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.11 
 
 		 255 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  67.59 
 
 		 259 aa  364  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  67.19 
 
 		 259 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  67.59 
 
 		 259 aa  363  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  67.98 
 
 		 259 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  67.19 
 
 		 259 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2789  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  67.98 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.782335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  67.98 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  66.8 
 
 		 259 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  66.8 
 
 		 259 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  67.06 
 
 		 261 aa  360  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  66.4 
 
 		 259 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  67.98 
 
 		 264 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  66.8 
 
 		 266 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  66.8 
 
 		 266 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  66.8 
 
 		 266 aa  358  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  67.59 
 
 		 274 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  67.59 
 
 		 274 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.19 
 
 		 264 aa  358  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  67.19 
 
 		 266 aa  357  9e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  67.19 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  67.19 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  67.19 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  67.19 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  67.19 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  66.01 
 
 		 263 aa  351  8e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  65.61 
 
 		 263 aa  350  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  67.59 
 
 		 254 aa  348  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  64.82 
 
 		 273 aa  348  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1091  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  70.47 
 
 		 279 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0481  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  70.47 
 
 		 279 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00989858  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0208  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  70.47 
 
 		 279 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1238  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  70.47 
 
 		 255 aa  345  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.251071  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.47 
 
 		 279 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378834  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1442  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.47 
 
 		 279 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2595  histidine transport ATP-binding protein  70.47 
 
 		 255 aa  344  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3794  ABC transporter related  69.96 
 
 		 255 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.921656  normal  0.0592425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4636  ABC transporter related  69.96 
 
 		 255 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3727  ABC transporter related  69.96 
 
 		 255 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409478  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2375  ABC transporter, ATPase subunit  69.57 
 
 		 266 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5466  ABC transporter related  69.96 
 
 		 255 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.501476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26210  ATP-binding component of histidine transport  67.86 
 
 		 255 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0271347  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5001  ABC transporter related  69.96 
 
 		 255 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.585593  normal  0.754245 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3609  ABC transporter related  69.96 
 
 		 255 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1408  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  69.96 
 
 		 255 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.106867  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  63.92 
 
 		 257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.82 
 
 		 254 aa  340  9e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4288  ABC transporter-like  67.98 
 
 		 254 aa  341  9e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  64.43 
 
 		 254 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2925  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, ATPase subunit  65.61 
 
 		 275 aa  339  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628075  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  65.48 
 
 		 285 aa  339  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1830  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  66.14 
 
 		 254 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2558  ABC transporter related  68.36 
 
 		 260 aa  332  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411241  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2913  ABC transporter related  66.01 
 
 		 254 aa  330  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.289619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3567  ABC transporter  65.75 
 
 		 254 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1090  ABC transporter related  66.01 
 
 		 254 aa  328  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455467  normal  0.0958562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4483  basic amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.61 
 
 		 254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1432  ABC transporter related  65.61 
 
 		 254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172857  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52750  arginine/ornithine transport protein AotP  66.01 
 
 		 254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3772  ABC transporter related  65.61 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446959  hitchhiker  0.00629002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4622  arginine/ornithine transport protein AotP  65.61 
 
 		 254 aa  325  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3988  ABC transporter related  65.22 
 
 		 254 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  61.69 
 
 		 256 aa  318  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  61.35 
 
 		 258 aa  310  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  60.48 
 
 		 257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1521  ABC transporter related  62.89 
 
 		 258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1259  ABC transporter related  60.64 
 
 		 260 aa  308  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  60.48 
 
 		 264 aa  308  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  61.29 
 
 		 257 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>