98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2599 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2599  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  100 
 
 
222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1867  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  91.89 
 
 
222 aa  417  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.563349  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1552  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  57.21 
 
 
222 aa  276  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2971  SAF domain-containing protein  55.05 
 
 
217 aa  230  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272825  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1586  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  47.37 
 
 
219 aa  209  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  46.61 
 
 
219 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1270  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  46.15 
 
 
219 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0241853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1285  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  46.61 
 
 
219 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115713  normal  0.0340077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2199  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  46.15 
 
 
219 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1241  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  46.15 
 
 
219 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.684745  normal  0.229528 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1997  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  50.26 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2426  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  50.26 
 
 
269 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  52 
 
 
232 aa  195  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2574  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  44.44 
 
 
219 aa  174  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01076  hypothetical protein  44.44 
 
 
219 aa  174  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01068  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein A  44.44 
 
 
219 aa  174  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1451  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  42.99 
 
 
219 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1195  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  42.08 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2528  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  42.08 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.728005  normal  0.0178665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1195  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  42.08 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  41.63 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2057  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  42.08 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1524  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  37.39 
 
 
234 aa  164  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2947  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  38.22 
 
 
424 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2925  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.82 
 
 
242 aa  114  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3733  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.03 
 
 
245 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5624  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.41 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1953  flageller protein FlgA  30.85 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.43 
 
 
295 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.277542  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2101  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.58 
 
 
254 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2992  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.58 
 
 
254 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3323  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.58 
 
 
254 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0461  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.59 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3071  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.58 
 
 
315 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3795  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  34.21 
 
 
504 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2936  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.58 
 
 
418 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0277  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.58 
 
 
507 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6372  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.94 
 
 
320 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682175  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0139  putative flagella basal body P-ring formation protein  33.68 
 
 
502 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0265  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.58 
 
 
509 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0748  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.95 
 
 
225 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3021  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.58 
 
 
388 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3026  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.31 
 
 
310 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.124973  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2412  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.31 
 
 
310 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3045  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.31 
 
 
408 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.279341 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0239  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.94 
 
 
538 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1979  flageller protein FlgA  29.15 
 
 
251 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4792  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.73 
 
 
291 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.245813 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3715  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.73 
 
 
291 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300126 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1318  flageller protein FlgA  31.74 
 
 
248 aa  98.6  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4200  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.06 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.75 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594164  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23990  Flagellar protein FlgA  25.46 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3099  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.29 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3826  SAF domain-containing protein  31.29 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.294228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0570  SAF domain-containing protein  31.71 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0634  SAF domain-containing protein  28.81 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4419  SAF domain-containing protein  27.27 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3713  flageller protein FlgA  27.4 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3074  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  30.3 
 
 
239 aa  71.6  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  27.85 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  27.06 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2735  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.85 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000036483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4670  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.8 
 
 
252 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  23.44 
 
 
243 aa  58.9  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1540  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  24.24 
 
 
255 aa  58.5  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  27.41 
 
 
248 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.91 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.14 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.42 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.16 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.42 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0259  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.83 
 
 
169 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  24.67 
 
 
238 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.67 
 
 
252 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.49 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.03 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.27 
 
 
252 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  24.32 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0153  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  23.77 
 
 
235 aa  49.3  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0673541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1175  SAF domain-containing protein  27.83 
 
 
235 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3450  SAF domain-containing protein  25.35 
 
 
238 aa  49.3  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0076  SAF domain-containing protein  27.34 
 
 
254 aa  48.9  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  24.02 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  23.12 
 
 
281 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0183  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.79 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0332  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  24 
 
 
310 aa  46.6  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.19 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.42 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3761  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.83 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.417921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  26.67 
 
 
248 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  28.93 
 
 
245 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3280  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  34.91 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  24.68 
 
 
347 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  24.5 
 
 
246 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  25 
 
 
265 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.85 
 
 
257 aa  42.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.19 
 
 
360 aa  42  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>