50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2334 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2334  phage shock protein B  100 
 
 		 74 aa  152  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2609  phage shock protein B  94.59 
 
 		 74 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00720004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2623  phage shock protein B  72 
 
 		 75 aa  112  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105345  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1787  phage shock protein B  72 
 
 		 75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2536  phage shock protein B  72 
 
 		 75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1895  phage shock protein B  72 
 
 		 75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1643  phage shock protein B  71.23 
 
 		 74 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1461  phage shock protein B  71.23 
 
 		 74 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.680677  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1814  phage shock protein B  71.23 
 
 		 74 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188952 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1875  phage shock protein B  71.23 
 
 		 74 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0101058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1813  phage shock protein B  71.23 
 
 		 74 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000257834 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1541  phage shock protein B  70.83 
 
 		 74 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1420  phage shock protein B  70.83 
 
 		 74 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2320  phage shock protein B  70.83 
 
 		 74 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.090335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1817  phage shock protein B  70.83 
 
 		 74 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1947  phage shock protein B  70.83 
 
 		 74 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01293  hypothetical protein  70.83 
 
 		 74 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01282  phage shock protein B  70.83 
 
 		 74 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2341  phage shock protein B  70.83 
 
 		 74 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00105318  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2168  phage shock protein B  68.92 
 
 		 74 aa  110  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1515  phage shock protein B  69.44 
 
 		 74 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1755  phage shock protein B  66.67 
 
 		 75 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1723  phage shock protein B  64.47 
 
 		 76 aa  98.2  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2103  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003813  phage shock protein B  50 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01873  phage shock protein B  47.3 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1282  phage shock protein B  47.95 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0482  phage shock protein B  50 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0407  phage shock protein B  44.44 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3771  phage shock protein B  46.38 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896291  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02832  phage shock protein B  47.83 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1617  phage shock protein B  43.48 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00230478  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2647  phage shock protein B  46.38 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1808  phage shock protein B  46.38 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2481  phage shock protein B  46.38 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810138 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2549  phage shock protein B  46.38 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.938994  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1618  phage shock protein B  46.38 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3099  phage shock protein B  46.38 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.555844  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1641  phage shock protein B  46.38 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.543996  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1607  phage shock protein B  46.38 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1238  phage shock protein B  47.83 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0677488 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2577  phage shock protein B  46.38 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.982322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2736  phage shock protein B  46.38 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121185  normal  0.12779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2495  phage shock protein B  46.38 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0474104  normal  0.0755646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1503  phage shock protein B  46.38 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2668  phage shock protein B  44.93 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1555  phage shock protein B  45.21 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000980293 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2479  phage shock protein B  42.03 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3003  phage shock protein B  47.54 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1217  phage shock protein B  35.53 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0496773  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0208  phage shock B  33.8 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>