More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2091 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2091  Peroxiredoxin  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.481334  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1602  peroxiredoxin OsmC  84.51 
 
 		 143 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.746338  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1677  peroxiredoxin OsmC  84.51 
 
 		 143 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1740  peroxiredoxin OsmC  84.51 
 
 		 143 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1679  peroxiredoxin OsmC  84.51 
 
 		 143 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1780  peroxiredoxin OsmC  84.51 
 
 		 143 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.778339  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01440  osmotically inducible, stress-inducible membrane protein  85.11 
 
 		 143 aa  248  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2165  OsmC family protein  85.11 
 
 		 143 aa  248  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.294382  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01452  hypothetical protein  85.11 
 
 		 143 aa  248  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.219956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2175  OsmC family protein  85.11 
 
 		 143 aa  248  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1664  peroxiredoxin OsmC  85.11 
 
 		 143 aa  248  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1567  peroxiredoxin OsmC  85.11 
 
 		 143 aa  248  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2094  peroxiredoxin OsmC  84.4 
 
 		 143 aa  246  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1745  peroxiredoxin OsmC  83.69 
 
 		 143 aa  244  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2041  OsmC family protein  80.28 
 
 		 142 aa  237  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.811079  normal  0.341975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1158  OsmC-like protein  62.41 
 
 		 143 aa  196  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1691  peroxiredoxin OsmC  84.07 
 
 		 116 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5086  OsmC family protein  61.7 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.252827  normal  0.822138 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0152  osmotically inducible protein  62.41 
 
 		 143 aa  183  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0097  OsmC-like protein  61.7 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00710  osmotically inducible protein OsmC  60.67 
 
 		 151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0107  OsmC family protein  64.03 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0059  osmotically inducible protein OsmC  62.86 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0040  OsmC-like protein  61.7 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0089  OsmC family protein  63.31 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0104  OsmC family protein  63.31 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0104  OsmC family protein  62.59 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000509604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1994  OsmC family protein  60.28 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5463  osmotically inducible protein OsmC  61.27 
 
 		 143 aa  173  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01800  OsmC-like protein  57.55 
 
 		 141 aa  170  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0270065  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3986  OsmC-like protein  62.22 
 
 		 143 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.347334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4674  OsmC family protein  62.22 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4453  OsmC family protein  57.14 
 
 		 141 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3472  OsmC family protein  58.45 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.359204  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1401  OsmC-like protein  61.48 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.655956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3760  Peroxiredoxin  57.75 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1421  OsmC-like protein  60 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2238  OsmC family protein  58.27 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8088  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0585  osmotically inducible protein OsmC  58.27 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1538  OsmC-like protein  59.15 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03308  osmotically inducible protein  56.34 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0488  OsmC family protein  57.55 
 
 		 140 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.358629  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3199  OsmC family protein  54.68 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0303  OsmC-like protein  55.71 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.263241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2579  OsmC family protein  55.07 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2261  OsmC family protein  55.07 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.427996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5465  OsmC family protein  56.83 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2304  OsmC family protein  55.07 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  hitchhiker  0.00777358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1145  putative OsmC-like protein  56.12 
 
 		 141 aa  153  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0924  OsmC family protein  56.83 
 
 		 140 aa  153  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0742  OsmC-like protein  53.52 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2374  OsmC-like protein  50.35 
 
 		 142 aa  147  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0467379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2450  OsmC family protein  51.06 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3133  OsmC family protein  58.87 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0138842  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0009  OsmC family protein  51.77 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0007  OsmC family protein  51.06 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4150  OsmC family protein  51.06 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0580  OsmC-like protein  51.41 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207251  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5223  OsmC family protein  56.12 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610628  normal  0.18726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2067  OsmC-like protein  46.76 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3272  osmotically inducible protein C  50.72 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1008  OsmC family protein  51.75 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0144  OsmC family protein  45.71 
 
 		 141 aa  133  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3893  OsmC family protein  52.34 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02004  peroxiredoxin OsmC  49.31 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3664  Peroxiredoxin  50.69 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444391  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0956  OsmC family protein  46.53 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0526  OsmC-like protein protein  39.86 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.455269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0381  OsmC family protein  45.32 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.639142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4026  OsmC family protein  47.18 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5540  peroxiredoxin, OsmC subfamily  48.23 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0142  OsmC-like protein  40.28 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1364  OsmC family protein  48.06 
 
 		 140 aa  123  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.680071  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5772  OsmC family protein  43.88 
 
 		 140 aa  121  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.255484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2339  OsmC family protein  47.48 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3669  OsmC family protein  49.65 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0059  redox protein, regulator of disulfide bond formation  46.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00217443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2252  osmotically inducible protein  43.26 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.599611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2716  peroxiredoxin, OsmC subfamily  45.32 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.126465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0962  OsmC family protein  47.06 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2726  peroxiredoxin, OsmC subfamily  41.84 
 
 		 138 aa  116  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.102217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7145  OsmC family protein  45 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3240  OsmC-like protein  45.52 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0122  OsmC family protein  42.66 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1350  OsmC family protein  41.73 
 
 		 138 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5587  peroxiredoxin, OsmC subfamily  45.24 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1108  OsmC family protein  43.88 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2232  OsmC family protein  41.01 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2586  OsmC family protein  42.55 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.32042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2843  osmotically inducible protein  45.97 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2899  OsmC family protein  40.71 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1962  OsmC family protein  45.45 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000828142  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4793  peroxiredoxin, OsmC subfamily  40.85 
 
 		 146 aa  103  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0859  OsmC family protein  43.66 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407191  normal  0.674013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32410  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  40.85 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03110  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  42.66 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4494  OsmC family protein  43.06 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.268183  normal  0.015469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7122  OsmC family protein  39.23 
 
 		 171 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2252  OsmC family protein  40.97 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2104  OsmC family protein  35.42 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0212711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>