49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2026 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2026  oriC-binding nucleoid-associated protein  100 
 
 		 71 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2326  oriC-binding nucleoid-associated protein  92.96 
 
 		 71 aa  140  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01595  predicted regulator  84.29 
 
 		 71 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0142757  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1814  oriC-binding nucleoid-associated protein  84.29 
 
 		 71 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1574  oriC-binding nucleoid-associated protein  84.29 
 
 		 71 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.209726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2337  oriC-binding nucleoid-associated protein  84.29 
 
 		 71 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2004  oriC-binding nucleoid-associated protein  84.29 
 
 		 71 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000476482  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1833  oriC-binding nucleoid-associated protein  84.29 
 
 		 71 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1701  oriC-binding nucleoid-associated protein  84.29 
 
 		 71 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01585  hypothetical protein  84.29 
 
 		 71 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2016  hemolysin expression modulating family protein  84.29 
 
 		 71 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000509834  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1823  oriC-binding nucleoid-associated protein  84.51 
 
 		 103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1915  oriC-binding nucleoid-associated protein  81.69 
 
 		 71 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1559  oriC-binding nucleoid-associated protein  81.43 
 
 		 71 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000113197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1631  oriC-binding nucleoid-associated protein  81.43 
 
 		 71 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.102344  normal  0.455792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1571  oriC-binding nucleoid-associated protein  81.43 
 
 		 71 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.145395 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1713  oriC-binding nucleoid-associated protein  81.43 
 
 		 71 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.095821  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1881  oriC-binding nucleoid-associated protein  81.43 
 
 		 71 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2153  oriC-binding nucleoid-associated protein  77.46 
 
 		 71 aa  120  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2990  hemolysin expression modulating family protein  62.69 
 
 		 71 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.502872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3214  hemolysin expression-modulating protein  41.43 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00381272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3034  hemolysin expression-modulating protein  41.43 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000595952  normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3073  hemolysin expression-modulating protein  41.43 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000183634  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0005  hypothetical protein  46.27 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1118  hemolysin expression-modulating protein  41.43 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524587  unclonable  0.00000000811136 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00416  hypothetical protein  37.14 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0550  hemolysin expression-modulating protein  37.14 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0523  hemolysin expression-modulating protein  37.14 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0220013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0517  hemolysin expression-modulating protein  37.14 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000983246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0514  hemolysin expression-modulating protein  37.14 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000755855  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0576  hemolysin expression-modulating protein  37.14 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0731512  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00411  modulator of gene expression, with H-NS  37.14 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3150  hemolysin expression modulating family protein  37.14 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0536  hemolysin expression-modulating protein  37.14 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0392  hemolysin expression-modulating protein  37.14 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3156  hemolysin expression-modulating protein  37.14 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0533  hemolysin expression-modulating protein  37.14 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.150441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0503  hemolysin expression-modulating protein  37.14 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1008  hemolysin expression-modulating protein  40.91 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0940  hemolysin expression-modulating protein  40 
 
 		 72 aa  47.4  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3052  hemolysin expression-modulating protein  39.39 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.029809  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0060  virulence modulating protein  34.29 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.158481  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0004  hypothetical protein  43.48 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606592  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0086  hypothetical protein  43.48 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.316924 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1065  hemolysin expression-modulating protein  37.88 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3246  hemolysin expression-modulating protein  37.88 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0005  hypothetical protein  37.68 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000926061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0085  hypothetical protein  37.68 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0277  hypothetical protein  37.88 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.298788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>