28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1777 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2721  chromosome segregation and condensation protein MukF  84.58 
 
 		 440 aa  778    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082112  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2049  condesin subunit F  97.51 
 
 		 441 aa  858    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0678198  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1777  condesin subunit F  100 
 
 		 441 aa  904    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.041681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2301  condesin subunit F  88.44 
 
 		 440 aa  809    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.370488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00933  hypothetical protein  84.58 
 
 		 440 aa  778    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00336906  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2200  condesin subunit F  87.07 
 
 		 440 aa  793    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1083  condesin subunit F  84.58 
 
 		 440 aa  781    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000724748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1057  condesin subunit F  84.58 
 
 		 440 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.886679  normal  0.0551551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0998  condesin subunit F  84.58 
 
 		 440 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0762943  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1106  condesin subunit F  84.58 
 
 		 440 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.562569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1090  condesin subunit F  84.58 
 
 		 440 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.199303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1025  condesin subunit F  84.58 
 
 		 440 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.252995  normal  0.616117 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2402  condesin subunit F  84.58 
 
 		 440 aa  777    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000536027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2198  condesin subunit F  84.58 
 
 		 440 aa  778    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000709701  normal  0.0963487 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2674  condesin subunit F  84.35 
 
 		 440 aa  777    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000312627  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2657  condesin subunit F  85.71 
 
 		 440 aa  787    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.533281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1969  condesin subunit F  85.71 
 
 		 440 aa  787    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1723  condesin subunit F  86.39 
 
 		 440 aa  795    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.721184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1021  condesin subunit F  84.58 
 
 		 440 aa  778    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000478423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1029  condesin subunit F  84.35 
 
 		 440 aa  777    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000114842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2567  condesin subunit F  85.71 
 
 		 440 aa  787    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1441  condesin subunit F  84.84 
 
 		 440 aa  782    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00926  condesin subunit F  84.58 
 
 		 440 aa  778    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00351613  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0864  condesin subunit F  65.53 
 
 		 440 aa  590  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00596599  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0729  condesin subunit F  62.33 
 
 		 445 aa  577  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00740317  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1319  condesin subunit F  61.43 
 
 		 445 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000193264  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003936  chromosome partition protein MukF  61.93 
 
 		 445 aa  568  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000070452  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01587  condesin subunit F  62.16 
 
 		 445 aa  568  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>