130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1406 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03994  C4-dicarboxylate antiporter  88.89 
 
 		 446 aa  725    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3869  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  88.89 
 
 		 446 aa  725    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2701  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  92.58 
 
 		 453 aa  774    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5637  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  88.89 
 
 		 446 aa  725    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.363668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4364  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  88.89 
 
 		 446 aa  725    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3863  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  88.34 
 
 		 446 aa  742    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03955  hypothetical protein  88.89 
 
 		 446 aa  725    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.905652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3904  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  88.89 
 
 		 446 aa  725    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1406  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 		 446 aa  889    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4589  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  88.89 
 
 		 446 aa  725    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4647  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  90.05 
 
 		 446 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4647  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  90.05 
 
 		 446 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1813  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  97.76 
 
 		 446 aa  815    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4556  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  90.05 
 
 		 446 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4565  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  90.05 
 
 		 446 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4696  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  89.81 
 
 		 446 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3576  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  71.75 
 
 		 446 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0772  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  68.53 
 
 		 474 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0697  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  68.75 
 
 		 474 aa  600  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0561  C4-dicarboxylate transporter, anaerobic  66.59 
 
 		 442 aa  588  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2479  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  54.73 
 
 		 447 aa  485  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.74 
 
 		 447 aa  481  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0307  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.97 
 
 		 447 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0302  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.97 
 
 		 447 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0298  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.97 
 
 		 447 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0303  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.97 
 
 		 447 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4417  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  54.2 
 
 		 447 aa  480  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.74 
 
 		 447 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600202 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.51 
 
 		 447 aa  478  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012855 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3222  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.08 
 
 		 447 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.84 
 
 		 447 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2500  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.05 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000075  C4-dicarboxylate like transporter  47.84 
 
 		 443 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.834607  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1023  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.37 
 
 		 442 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05690  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.92 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1566  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.35 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4182  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.8 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.877677 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1800  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.8 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.920741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.8 
 
 		 447 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3540  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.31 
 
 		 442 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000247021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1304  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.72 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000133068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2921  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.72 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2751  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.83 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3993  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.19 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000171498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3841  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.51 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2120  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.5 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0685  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.79 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1173  anaerobic C4-dicarboxylate membrane transporter  69.26 
 
 		 555 aa  358  8e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0146  anaerobic C4-dicarboxylate membrane transporter  72.45 
 
 		 557 aa  350  2e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2657  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  41.27 
 
 		 433 aa  346  5e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000544517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1721  FUR family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 558 aa  342  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3278  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  40.86 
 
 		 443 aa  338  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.737723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3845  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  40.54 
 
 		 441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1000  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  62.88 
 
 		 559 aa  334  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.921099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2084  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.67 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1756  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.44 
 
 		 453 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2178  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.89 
 
 		 453 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1227  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.77 
 
 		 437 aa  322  6e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0182987  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0158  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.31 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1605  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  38.64 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0441  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.95 
 
 		 437 aa  320  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0488  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.95 
 
 		 437 aa  318  9e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0364  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.95 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0354  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.95 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0351  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.95 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0378  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.95 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0421  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.18 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4883  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.73 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0366  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.27 
 
 		 437 aa  316  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0489  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.73 
 
 		 437 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.95 
 
 		 437 aa  316  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2007  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  39.32 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0240  hypothetical protein  36.82 
 
 		 439 aa  300  4e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3974  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.72 
 
 		 439 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3913  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.39 
 
 		 439 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.689386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3793  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.92 
 
 		 439 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3805  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.92 
 
 		 439 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3871  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.84 
 
 		 439 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0588  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.44 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3893  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  36.22 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3408  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.29 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3533  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.36 
 
 		 433 aa  273  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1121  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.22 
 
 		 438 aa  272  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0505  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.74 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0325  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.02 
 
 		 433 aa  271  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3679  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.18 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.18 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3826  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.18 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0639  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  37.73 
 
 		 433 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3748  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  37.73 
 
 		 433 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0617  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  37.73 
 
 		 433 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04008  C4-dicarboxylate antiporter  36.28 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3854  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  36.28 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5654  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.28 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00371648  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4379  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.28 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0860444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3874  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.28 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03970  hypothetical protein  36.28 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4607  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.28 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.104112  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4667  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.28 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4693  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.05 
 
 		 433 aa  266  7e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>