135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0881 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0881  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  191  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3408  hypothetical protein  98.89 
 
 		 90 aa  190  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.070297  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4044  hypothetical protein  91.01 
 
 		 90 aa  174  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.846372  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3207  Fe(II) trafficking protein YggX  87.78 
 
 		 90 aa  172  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261297  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0818  hypothetical protein  86.52 
 
 		 90 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0152  hypothetical protein  86.52 
 
 		 90 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.957602  hitchhiker  0.0000034562 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0819  hypothetical protein  86.52 
 
 		 90 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02792  hypothetical protein  88.51 
 
 		 91 aa  167  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0733  Protein-tyrosine-phosphatase  88.51 
 
 		 91 aa  167  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4266  hypothetical protein  88.51 
 
 		 91 aa  167  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3454  hypothetical protein  88.51 
 
 		 91 aa  167  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.811336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3285  hypothetical protein  88.51 
 
 		 91 aa  167  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200191  normal  0.033805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02755  hypothetical protein  88.51 
 
 		 91 aa  167  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3367  hypothetical protein  87.5 
 
 		 90 aa  168  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0165991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3351  hypothetical protein  88.51 
 
 		 91 aa  167  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.496198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3275  hypothetical protein  88.51 
 
 		 91 aa  167  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3359  hypothetical protein  88.51 
 
 		 91 aa  167  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0970298 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3308  hypothetical protein  88.51 
 
 		 91 aa  167  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0752  hypothetical protein  88.51 
 
 		 91 aa  167  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.493276  normal  0.0113195 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3105  hypothetical protein  88.51 
 
 		 91 aa  167  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3395  hypothetical protein  88.51 
 
 		 91 aa  167  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3027  Fe(II) trafficking protein YggX  86.36 
 
 		 90 aa  165  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0002  hypothetical protein  76.4 
 
 		 90 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000338126  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002445  hypothetical protein  75.28 
 
 		 90 aa  148  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000631832  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03592  hypothetical protein  75.28 
 
 		 90 aa  147  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1668  hypothetical protein  70.79 
 
 		 91 aa  145  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1107  hypothetical protein  71.26 
 
 		 92 aa  141  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149514  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1179  hypothetical protein  70.11 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1250  hypothetical protein  70.11 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00387926  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1180  hypothetical protein  70.11 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000191738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2874  hypothetical protein  69.66 
 
 		 92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429816  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2491  hypothetical protein  71.59 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0533  hypothetical protein  70.79 
 
 		 90 aa  138  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000920147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1218  hypothetical protein  68.97 
 
 		 92 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000284712  normal  0.540197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1324  hypothetical protein  70.11 
 
 		 92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000513126  normal  0.0116062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3040  hypothetical protein  70.11 
 
 		 92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000474974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2701  hypothetical protein  70.11 
 
 		 92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665477  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3054  hypothetical protein  70.11 
 
 		 92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00037558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3197  hypothetical protein  70.11 
 
 		 92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000564871  normal  0.56493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2699  hypothetical protein  69.32 
 
 		 91 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000360658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3369  hypothetical protein  71.26 
 
 		 92 aa  137  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4149  hypothetical protein  67.42 
 
 		 90 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.786111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1122  hypothetical protein  67.82 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000145882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1318  hypothetical protein  67.82 
 
 		 92 aa  134  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.959327  normal  0.498401 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0375  hypothetical protein  63.22 
 
 		 89 aa  127  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.374308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0075  hypothetical protein  63.64 
 
 		 90 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.206235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00283  hypothetical protein  60.23 
 
 		 90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0478  hypothetical protein  66.23 
 
 		 77 aa  115  3e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.252917  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1544  hypothetical protein  56.32 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251513  normal  0.581544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2944  hypothetical protein  51.69 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0133  hypothetical protein  52.22 
 
 		 109 aa  100  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1372  hypothetical protein  44.94 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2268  hypothetical protein  51.14 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68000  hypothetical protein  50.56 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0291982  normal  0.0102639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5885  hypothetical protein  50.56 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1924  hypothetical protein  47.19 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441849  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1798  hypothetical protein  47.19 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.716542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1524  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.384209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2229  hypothetical protein  47.78 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1057  hypothetical protein  51.14 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.977359  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1850  Fe(II) trafficking protein YggX  51.14 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.302914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3583  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.507536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2344  hypothetical protein  47.19 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0938  hypothetical protein  51.14 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4260  hypothetical protein  48.31 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221746  hitchhiker  0.00000000242965 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0687  hypothetical protein  48.86 
 
 		 91 aa  94  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.166712  normal  0.641044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2102  hypothetical protein  46.07 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.183711  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0024  hypothetical protein  47.25 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.828588  normal  0.104747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2423  hypothetical protein  46.07 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2982  hypothetical protein  48.35 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0285  hypothetical protein  48.31 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0305  hypothetical protein  48.31 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0310  hypothetical protein  48.31 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1490  hypothetical protein  51.65 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0380307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1263  hypothetical protein  45.56 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.339369  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5343  hypothetical protein  46.59 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4902  hypothetical protein  46.59 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04520  hypothetical protein  47.73 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.683421  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2485  Fe(II) trafficking protein YggX  47.78 
 
 		 91 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0570791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1132  hypothetical protein  48.84 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4923  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000436986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1511  hypothetical protein  51.11 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1002  hypothetical protein  48.84 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0880728  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1891  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2624  hypothetical protein  51.11 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.804415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3047  hypothetical protein  47.19 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45877  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1902  hypothetical protein  45.88 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2572  hypothetical protein  48.31 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1222  hypothetical protein  43.82 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2959  hypothetical protein  48.31 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0319  hypothetical protein  44.94 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0490853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4642  hypothetical protein  46.07 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451223  hitchhiker  0.0000118597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1836  hypothetical protein  47.25 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3177  hypothetical protein  46.59 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.293941  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5466  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0121  hypothetical protein  46.34 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5920  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2157  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01429  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25922  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1114  hypothetical protein  48.35 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158096  normal  0.927439 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>