24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0089 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0089  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0085  hypothetical protein  96.81 
 
 
188 aa  340  7e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3879  hypothetical protein  64.55 
 
 
185 aa  237  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0230  hypothetical protein  62.7 
 
 
175 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0568  hypothetical protein  62.7 
 
 
175 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3988  hypothetical protein  62.7 
 
 
175 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.899089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3952  hypothetical protein  63.83 
 
 
185 aa  230  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411335  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3782  hypothetical protein  63.83 
 
 
185 aa  230  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3772  hypothetical protein  63.83 
 
 
185 aa  230  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3892  hypothetical protein  63.83 
 
 
185 aa  230  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3849  hypothetical protein  63.83 
 
 
185 aa  230  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3850  hypothetical protein  62.37 
 
 
185 aa  230  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03274  hypothetical protein  62.37 
 
 
185 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4792  hypothetical protein  62.37 
 
 
185 aa  230  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03321  periplasmic protein  62.37 
 
 
185 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3756  hypothetical protein  62.37 
 
 
185 aa  230  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0244  hypothetical protein  62.37 
 
 
185 aa  230  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3954  hypothetical protein  62.37 
 
 
185 aa  230  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3671  hypothetical protein  62.37 
 
 
185 aa  230  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0243  conserved hypothetical protein  62.37 
 
 
185 aa  230  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0203  hypothetical protein  63.3 
 
 
187 aa  227  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0628423 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4071  hypothetical protein  59.89 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3884  hypothetical protein  48.15 
 
 
190 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0088  hypothetical protein  24.32 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>