34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_68970 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_68970  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  327  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5965  hypothetical protein  95 
 
 
160 aa  315  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5023  hypothetical protein  69.28 
 
 
160 aa  230  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5198  hypothetical protein  68.63 
 
 
160 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5432  hypothetical protein  68.83 
 
 
161 aa  227  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5258  hypothetical protein  67.97 
 
 
160 aa  226  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5105  hypothetical protein  67.97 
 
 
160 aa  225  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0979763  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2166  hypothetical protein  54.79 
 
 
184 aa  175  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01871  lipoprotein, putative  55.48 
 
 
223 aa  163  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2917  hypothetical protein  52.35 
 
 
150 aa  163  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.389629  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1327  hypothetical protein  53.64 
 
 
162 aa  159  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0956  hypothetical protein  54.01 
 
 
141 aa  159  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1255  hypothetical protein  55.17 
 
 
179 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.641108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01340  hypothetical protein  43.79 
 
 
167 aa  154  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004125  hypothetical protein  43.14 
 
 
167 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000493845  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1689  hypothetical protein  43.87 
 
 
166 aa  149  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000692743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1855  hypothetical protein  48.97 
 
 
164 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790822  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2318  hypothetical protein  47.89 
 
 
185 aa  148  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701978  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0834  hypothetical protein  44.9 
 
 
154 aa  148  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2015  hypothetical protein  47.18 
 
 
185 aa  144  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179761  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3579  hypothetical protein  50.65 
 
 
163 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3511  hypothetical protein  51.03 
 
 
163 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2058  hypothetical protein  48.97 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2397  hypothetical protein  47.22 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45413  predicted protein  45.51 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000791095  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00290  hypothetical protein  47.26 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0513  hypothetical protein  44.06 
 
 
172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00777462  normal  0.634393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1465  hypothetical protein  45.45 
 
 
156 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1802  hypothetical protein  43.33 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0975  hypothetical protein  43.75 
 
 
157 aa  122  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.149641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0090  hypothetical protein  38.51 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1551  hypothetical protein  37.11 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147627  hitchhiker  0.00645173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2158  translation elongation factor P (EF-P)  33.77 
 
 
161 aa  92  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401757  normal  0.635134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>