More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_41080 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_41080  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
160 aa  332  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  96.25 
 
 
258 aa  320  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  67.5 
 
 
255 aa  224  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  67.08 
 
 
259 aa  222  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  67.08 
 
 
259 aa  221  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  66.25 
 
 
257 aa  214  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  63.58 
 
 
259 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  63.35 
 
 
259 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  64.2 
 
 
259 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  63.35 
 
 
259 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  62.5 
 
 
258 aa  205  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  59.51 
 
 
258 aa  185  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.79 
 
 
259 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  52.83 
 
 
265 aa  182  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.32 
 
 
269 aa  181  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.63 
 
 
245 aa  179  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.7 
 
 
263 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.17 
 
 
259 aa  173  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.83 
 
 
259 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.76 
 
 
258 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  54.09 
 
 
284 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.43 
 
 
263 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.06 
 
 
263 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.97 
 
 
255 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.52 
 
 
256 aa  171  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.43 
 
 
263 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  55 
 
 
267 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  53.9 
 
 
257 aa  170  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.7 
 
 
256 aa  170  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.9 
 
 
260 aa  170  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  52.8 
 
 
263 aa  169  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.09 
 
 
266 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.52 
 
 
240 aa  168  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.8 
 
 
257 aa  168  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.46 
 
 
257 aa  168  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.9 
 
 
250 aa  167  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.14 
 
 
264 aa  167  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  54.9 
 
 
250 aa  167  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2611  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.63 
 
 
263 aa  166  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328129  normal  0.860285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  54.14 
 
 
267 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.5 
 
 
257 aa  166  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.53 
 
 
257 aa  166  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.53 
 
 
267 aa  164  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.25 
 
 
260 aa  164  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.16 
 
 
257 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1989  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.6 
 
 
272 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000136825  hitchhiker  0.000132084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.1 
 
 
259 aa  164  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  55.77 
 
 
267 aa  163  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  54.84 
 
 
252 aa  163  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.94 
 
 
257 aa  162  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.3 
 
 
258 aa  163  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  50.94 
 
 
266 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.47 
 
 
263 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  52.5 
 
 
257 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.1 
 
 
259 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.8 
 
 
263 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  47.4 
 
 
265 aa  160  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.77 
 
 
257 aa  160  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  47.77 
 
 
257 aa  160  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.85 
 
 
295 aa  160  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.38 
 
 
252 aa  159  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.59 
 
 
260 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.21 
 
 
295 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.61 
 
 
258 aa  158  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.85 
 
 
278 aa  157  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
257 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.75 
 
 
257 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2788  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.66 
 
 
268 aa  157  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000589518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.23 
 
 
256 aa  156  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0765  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.8 
 
 
268 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1275  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.8 
 
 
268 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2406  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.73 
 
 
263 aa  156  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000139632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1468  metallo-beta-lactamase family protein  52.8 
 
 
268 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0558  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.8 
 
 
268 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0594  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.8 
 
 
268 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.5 
 
 
252 aa  156  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.5 
 
 
256 aa  156  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.09 
 
 
279 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.78 
 
 
257 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
271 aa  155  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.19 
 
 
273 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000343  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.14 
 
 
257 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.69 
 
 
250 aa  154  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.35 
 
 
256 aa  153  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.83 
 
 
279 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.31 
 
 
258 aa  153  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.69 
 
 
259 aa  153  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2033  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.2 
 
 
268 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000269745  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.25 
 
 
251 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.69 
 
 
258 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.25 
 
 
256 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1164  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.93 
 
 
260 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000229771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.52 
 
 
263 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.37 
 
 
251 aa  150  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3396  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.25 
 
 
251 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0224  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.25 
 
 
251 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1176  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.19 
 
 
273 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000239023  normal  0.0635677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.73 
 
 
259 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0226  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.25 
 
 
251 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.66 
 
 
256 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>