22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28790 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_28790  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000160296  decreased coverage  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  65.38 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  65.38 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  63.46 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  63.46 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  63.46 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  62.75 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  62.75 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  59.62 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  59.62 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  59.62 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  51.92 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  51.92 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  56.86 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  47.06 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  46 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  48 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  41.18 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  44 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  40.38 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  40 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  45.1 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>