30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22740 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_22740  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443318  normal  0.0477687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1921  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3793  hypothetical protein  66.21 
 
 		 138 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000194694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4010  protein of unknown function Spy-related  60 
 
 		 138 aa  157  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.497545  hitchhiker  0.0000098049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1407  protein of unknown function, Spy-related  59.31 
 
 		 138 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0117564  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4504  hypothetical protein  58.62 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.214225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1482  hypothetical protein  54.48 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109607  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3590  hypothetical protein  52.94 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0505137  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1805  hypothetical protein  57.75 
 
 		 154 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656066  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1830  protein of unknown function, Spy-related  55.74 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15600  hypothetical protein  49.19 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0450221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  35.67 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  35.62 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  33.78 
 
 		 162 aa  48.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  33.11 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  34.64 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  34.64 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  33.99 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  27.67 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  33.99 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  34.25 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  34.25 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  34.25 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  34.29 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  33.99 
 
 		 161 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  33.99 
 
 		 161 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  33.99 
 
 		 161 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  33.56 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  34.97 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  32.21 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>