135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22280 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_22280  putative pirin-related protein  100 
 
 
87 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000162448  unclonable  1.99584e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  153  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  72.22 
 
 
284 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  72.22 
 
 
284 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  69.44 
 
 
284 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  65.75 
 
 
294 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  63.01 
 
 
289 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  62.5 
 
 
280 aa  100  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  70.97 
 
 
287 aa  100  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  57.83 
 
 
278 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  56.63 
 
 
286 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  66.67 
 
 
298 aa  97.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  55.95 
 
 
294 aa  97.1  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  61.64 
 
 
298 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  61.64 
 
 
298 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  63.38 
 
 
304 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  68.18 
 
 
285 aa  94  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  62.32 
 
 
293 aa  93.6  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  61.76 
 
 
284 aa  93.6  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  61.97 
 
 
307 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  70 
 
 
286 aa  90.5  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  56.34 
 
 
290 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  56.34 
 
 
290 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  56.25 
 
 
299 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  54.76 
 
 
310 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  59.42 
 
 
299 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  58.33 
 
 
283 aa  88.2  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  53.73 
 
 
279 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  66.07 
 
 
284 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  51.47 
 
 
289 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  60.29 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  51.39 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  52.86 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  55.22 
 
 
282 aa  82  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  52.86 
 
 
285 aa  81.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  50.7 
 
 
283 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  50 
 
 
301 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  69.7 
 
 
283 aa  81.3  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  52.17 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  52.05 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  50.65 
 
 
296 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  52.94 
 
 
312 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  59.65 
 
 
286 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  59.65 
 
 
286 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  50 
 
 
298 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  59.65 
 
 
286 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  48.61 
 
 
274 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  52.05 
 
 
303 aa  77  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  48.61 
 
 
302 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  53.62 
 
 
303 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  51.95 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  49.25 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  44 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  53.52 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  48.61 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  48.61 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  47.56 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  49.25 
 
 
279 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  47.22 
 
 
282 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  53.85 
 
 
282 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  51.35 
 
 
288 aa  73.9  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  49.28 
 
 
303 aa  73.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  50 
 
 
302 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  51.32 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  46.58 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  45.21 
 
 
309 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
282 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  50.72 
 
 
306 aa  70.9  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  52.54 
 
 
283 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  50.77 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  45.07 
 
 
282 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  52.46 
 
 
292 aa  67.8  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  45.76 
 
 
277 aa  67.8  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  47.06 
 
 
303 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  50 
 
 
288 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  47.69 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  44.62 
 
 
285 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  44.62 
 
 
295 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  44.62 
 
 
285 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  44.62 
 
 
290 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  46.15 
 
 
288 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  44.62 
 
 
285 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0895  pirin family protein  47.69 
 
 
285 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0744  pirin domain-containing protein  46.15 
 
 
285 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3276  pirin domain-containing protein  46.15 
 
 
285 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
285 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  45.59 
 
 
301 aa  62  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  52.63 
 
 
310 aa  61.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2994  pirin family protein  49.15 
 
 
284 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  48.61 
 
 
302 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  40 
 
 
328 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01780  conserved hypothetical protein  42.65 
 
 
337 aa  54.3  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293563  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3010  pirin-related protein  43.1 
 
 
255 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28358  RNA pol II transcription cofactor  37.35 
 
 
339 aa  52  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2876  Pirin domain protein  62.16 
 
 
250 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  42.5 
 
 
290 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  42.5 
 
 
290 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  42.5 
 
 
290 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  42.5 
 
 
290 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  42.5 
 
 
290 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>