More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_18521 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_18521  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 115 aa  225  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1754  50S ribosomal protein L20  94.74 
 
 		 115 aa  187  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18521  50S ribosomal protein L20  92.98 
 
 		 115 aa  183  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.331262  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18711  50S ribosomal protein L20  90.43 
 
 		 115 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0054  50S ribosomal protein L20  78.57 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.604551  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0057  50S ribosomal protein L20  77.68 
 
 		 115 aa  151  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00591  50S ribosomal protein L20  76.79 
 
 		 115 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17881  50S ribosomal protein L20  73.91 
 
 		 115 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0873829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21311  50S ribosomal protein L20  78.9 
 
 		 115 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.105631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1260  50S ribosomal protein L20  78.9 
 
 		 115 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  65.45 
 
 		 118 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1277  50S ribosomal protein L20  77.27 
 
 		 116 aa  140  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4255  50S ribosomal protein L20  70.43 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  60.36 
 
 		 117 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1478  50S ribosomal protein L20  67.83 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.910171 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  56.76 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2606  50S ribosomal protein L20  71.17 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  59.13 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3500  50S ribosomal protein L20  71.17 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.193711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  60.36 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  59.46 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 		 117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  57.27 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 		 118 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  61.26 
 
 		 117 aa  133  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3448  50S ribosomal protein L20  70.64 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  61.76 
 
 		 119 aa  131  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 119 aa  131  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 119 aa  131  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1087  50S ribosomal protein L20  61.76 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000484825  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  61.26 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  60.36 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  60.36 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4309  50S ribosomal protein L20  68.81 
 
 		 118 aa  130  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  60.36 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  56.88 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  61.26 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  61.26 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  61.26 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  61.26 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  58.72 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1993  50S ribosomal protein L20  61.32 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  129  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2227  50S ribosomal protein L20  61.32 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200707 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  56.88 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  60.36 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  61.26 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  61.26 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  56.76 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  54.05 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  60.36 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 		 117 aa  126  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 117 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1239  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000443889  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1882  50S ribosomal protein L20  66.67 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0641503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  52.25 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  52.25 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1010  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0761247  hitchhiker  0.00845124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  54.46 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2031  50S ribosomal protein L20P  59 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000296283  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  56.36 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  56.76 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 		 119 aa  120  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  52.25 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0134  50S ribosomal protein L20  56.76 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  53.15 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1882  50S ribosomal protein L20  60.58 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96166  normal  0.0688359 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  51.3 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1885  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0110106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>