More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_19551 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_19551  30S ribosomal protein S16  100 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.669471 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13321  30S ribosomal protein S16  83.49 
 
 
125 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.257146  normal  0.676995 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0852  30S ribosomal protein S16  84.62 
 
 
110 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17051  30S ribosomal protein S16  85.29 
 
 
110 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.701921  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0883  30S ribosomal protein S16  89.58 
 
 
135 aa  176  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738027  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14461  30S ribosomal protein S16  74.34 
 
 
114 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1516  30S ribosomal protein S16  88.17 
 
 
130 aa  170  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14841  30S ribosomal protein S16  74.34 
 
 
121 aa  170  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321531  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1381  30S ribosomal protein S16  70.49 
 
 
121 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14701  30S ribosomal protein S16  73.45 
 
 
121 aa  166  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2536  SSU ribosomal protein S16P  70.51 
 
 
141 aa  123  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000571366  decreased coverage  0.00236598 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1772  30S ribosomal protein S16  72.15 
 
 
82 aa  120  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4357  30S ribosomal protein S16  65.88 
 
 
86 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000000929169  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1143  30S ribosomal protein S16  67.5 
 
 
86 aa  117  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0121256  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1956  30S ribosomal protein S16  66.25 
 
 
82 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1983  30S ribosomal protein S16  66.25 
 
 
82 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5264  30S ribosomal protein S16  66.25 
 
 
82 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2772  30S ribosomal protein S16  66.25 
 
 
82 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.48934 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  55.41 
 
 
79 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1092  ribosomal protein S16  43.7 
 
 
119 aa  86.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000161695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 
79 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 
79 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  49.35 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  45.12 
 
 
86 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf245  ribosomal protein S16  50.68 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00213273  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  47.3 
 
 
79 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  46.15 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  46.15 
 
 
82 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 
81 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  45.68 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  44.44 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  43.04 
 
 
81 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  46.25 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  44.3 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  42.5 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  38.83 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  43.75 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  43.75 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  43.75 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  42.5 
 
 
92 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  44.59 
 
 
81 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  42.5 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19103  predicted protein  43.9 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  45 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  43.75 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  38.75 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  40.51 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  42.86 
 
 
86 aa  70.5  0.000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  37.4 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  43.59 
 
 
191 aa  70.1  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 
81 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 
81 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  37.04 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  37.04 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  46.51 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  42.11 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  42.11 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  42.68 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  42.68 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  42.11 
 
 
81 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1447  ribosomal protein S16  42.68 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  39.51 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  42.86 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  39.51 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  37.5 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  45.35 
 
 
116 aa  66.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2709  30S ribosomal protein S16  45.35 
 
 
116 aa  66.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0297256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  37.65 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  40 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  40 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  39.77 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  40 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  40 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  39.74 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  38.46 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  40 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  38.75 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  38.27 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  38.75 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  39.47 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  43.75 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3136  ribosomal protein S16  38.75 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0537506  normal  0.10713 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1863  ribosomal protein S16  43.37 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000617647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  42.31 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>