More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_07751 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_07751  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  100 
 
 
481 aa  982    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1637  RNA binding S1  72.96 
 
 
412 aa  587  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397933  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0726  SSU ribosomal protein S1P  71 
 
 
424 aa  581  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05331  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  64.24 
 
 
416 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.422935  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  63.19 
 
 
465 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1861  SSU ribosomal protein S1P  62.67 
 
 
431 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0931144  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05941  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  54.33 
 
 
408 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05561  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  56.31 
 
 
401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.748166  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0530  SSU ribosomal protein S1P  55.45 
 
 
404 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  56.06 
 
 
401 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.974619  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1591  RNA binding S1  47.18 
 
 
295 aa  266  8.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.762694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2933  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.39 
 
 
301 aa  264  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0419  RNA binding S1 domain protein  42.95 
 
 
302 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0430  RNA binding S1 domain protein  42.95 
 
 
302 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.930952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3732  SSU ribosomal protein S1P  43.97 
 
 
302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000110633  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2502  SSU ribosomal protein S1P  46.82 
 
 
304 aa  254  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230802  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1211  RNA binding S1 domain protein  41.34 
 
 
284 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3643  RNA binding S1 domain protein  41.22 
 
 
292 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3072  30S ribosomal protein S1  39.02 
 
 
331 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3048  30S ribosomal protein S1  39.02 
 
 
331 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00340355  normal  0.25508 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22161  30S ribosomal protein S1  38.68 
 
 
367 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0468  30S ribosomal protein S1  39.32 
 
 
386 aa  206  8e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4111  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.37 
 
 
341 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1505  30S ribosomal protein S1  38.06 
 
 
343 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000040832  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3490  30S ribosomal protein S1  37.28 
 
 
328 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4028  30S ribosomal protein S1  37.98 
 
 
321 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.861757  hitchhiker  0.00019437 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1867  30S ribosomal protein S1  38.91 
 
 
367 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.61448  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03471  30S ribosomal protein S1  37.38 
 
 
371 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1689  30S ribosomal protein S1  38.33 
 
 
369 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03371  30S ribosomal protein S1  37.54 
 
 
363 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04021  30S ribosomal protein S1  38.33 
 
 
369 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03361  30S ribosomal protein S1  37.17 
 
 
363 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4663  30S ribosomal protein S1  36.43 
 
 
390 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608752  decreased coverage  0.00279875 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10847  predicted protein  38.57 
 
 
284 aa  193  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695244  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0318  30S ribosomal protein S1  36.72 
 
 
366 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.721162  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03451  30S ribosomal protein S1  37.98 
 
 
363 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0694  30S ribosomal protein S1  37.93 
 
 
307 aa  190  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000685189  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36339  Plastid ribosomal protein S1, imported to chloroplast, small ribosomal subunit  34.86 
 
 
339 aa  177  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  30.85 
 
 
397 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  29.18 
 
 
587 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.4 
 
 
403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  31.25 
 
 
411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4287  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.41 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000310337  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  32.17 
 
 
598 aa  131  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  30.77 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0934  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.41 
 
 
388 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000731277  normal  0.167396 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  28.08 
 
 
686 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2405  30S ribosomal protein S1  33.46 
 
 
378 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  31.66 
 
 
687 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  32.05 
 
 
736 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2117  30S ribosomal protein S1  33.07 
 
 
378 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  28.88 
 
 
490 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  33.09 
 
 
558 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  29.5 
 
 
678 aa  120  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  28.98 
 
 
485 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  29.37 
 
 
720 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  28.98 
 
 
496 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  32.27 
 
 
385 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.57 
 
 
415 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3713  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.45 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000276005  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  27.51 
 
 
493 aa  117  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  28.79 
 
 
672 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  28.04 
 
 
529 aa  116  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  26.88 
 
 
487 aa  116  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  31.68 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  26.52 
 
 
479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  26.52 
 
 
479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  26.52 
 
 
479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  28.14 
 
 
644 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  28.78 
 
 
480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  27.5 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  31.08 
 
 
596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  27.24 
 
 
493 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2000  30S ribosomal protein S1  28.46 
 
 
591 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000749746  normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  30.89 
 
 
387 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  26.52 
 
 
481 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  26.52 
 
 
481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1350  RNA binding S1 domain protein  30.89 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  27.24 
 
 
492 aa  114  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  26.64 
 
 
491 aa  114  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  28.15 
 
 
515 aa  114  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0639  30S ribosomal protein S1  33.47 
 
 
400 aa  114  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.136649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  30.68 
 
 
661 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10333  30S ribosomal protein S1  26.82 
 
 
619 aa  113  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.869439  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0129  30S ribosomal protein S1  28.8 
 
 
586 aa  113  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  28.3 
 
 
599 aa  113  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  28.57 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0714  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  30.5 
 
 
694 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000369991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  28.42 
 
 
487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  30.96 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  28.57 
 
 
488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5663  RNA binding S1 domain protein  29.07 
 
 
595 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726551  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  31.43 
 
 
382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  28.37 
 
 
485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  26.64 
 
 
495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  28 
 
 
495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  26.71 
 
 
485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  27.24 
 
 
488 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0644  30S ribosomal protein S1  28.97 
 
 
611 aa  111  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.35055 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  28.01 
 
 
496 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.287124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>