11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2955 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2955  hypothetical protein  100 
 
 		 704 aa  1461    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279784  normal  0.44486 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2899  hypothetical protein  49.6 
 
 		 550 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2896  hypothetical protein  46.38 
 
 		 542 aa  486  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5641  hypothetical protein  23.12 
 
 		 667 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000396754  normal  0.777644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0330  hypothetical protein  35.26 
 
 		 684 aa  76.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2588  hypothetical protein  25.94 
 
 		 585 aa  73.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2974  hypothetical protein  25.94 
 
 		 585 aa  73.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  22.82 
 
 		 1141 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2744  hypothetical protein  26.63 
 
 		 684 aa  71.6  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1634  hypothetical protein  25 
 
 		 789 aa  60.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5011  hypothetical protein  26.59 
 
 		 951 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.261042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>