20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2585 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2585  cytochrome c class I  100 
 
 		 112 aa  229  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3126  cytochrome c class I  31.78 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2649  cytochrome c, class IC  28.32 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3282  cytochrome c, class IC  28.32 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  32.95 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2356  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.18 
 
 		 498 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3207  cytochrome c class I  29.87 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.565348  decreased coverage  0.00513342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  30.86 
 
 		 248 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  31.03 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  32.05 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  20.75 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  30.7 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  28.4 
 
 		 155 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  30.86 
 
 		 105 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  30.86 
 
 		 105 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 105 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  23.3 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31 
 
 		 637 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>