More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2337 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2337  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
316 aa  642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  hitchhiker  0.00803465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  82.91 
 
 
316 aa  526  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.470137 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.97 
 
 
309 aa  390  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
327 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.63 
 
 
323 aa  334  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
323 aa  333  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.72 
 
 
313 aa  333  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.59 
 
 
316 aa  332  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.28 
 
 
314 aa  330  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
316 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.45 
 
 
317 aa  329  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
327 aa  329  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 
317 aa  328  6e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.31 
 
 
331 aa  328  8e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.79 
 
 
316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
323 aa  326  3e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
321 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.81 
 
 
314 aa  325  8.000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.02 
 
 
318 aa  324  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.48 
 
 
359 aa  323  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.28 
 
 
314 aa  323  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  52.73 
 
 
312 aa  322  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.1 
 
 
316 aa  322  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.13 
 
 
338 aa  321  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.44 
 
 
330 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.05 
 
 
317 aa  320  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_002950  PG2097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.8 
 
 
338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.72 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.6 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
315 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
321 aa  318  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  51.13 
 
 
317 aa  318  7.999999999999999e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
318 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
318 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
309 aa  317  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 
315 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.51 
 
 
309 aa  316  4e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
321 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
321 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
331 aa  315  7e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.1 
 
 
322 aa  314  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  50.48 
 
 
321 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.47 
 
 
311 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.82 
 
 
309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 
328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
317 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.64 
 
 
331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.62 
 
 
325 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.82 
 
 
309 aa  311  7.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.82 
 
 
309 aa  311  9e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
337 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.09 
 
 
310 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
317 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
317 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
317 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
317 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.92 
 
 
317 aa  310  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
316 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.64 
 
 
330 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.41 
 
 
310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.31 
 
 
309 aa  308  6.999999999999999e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.78 
 
 
310 aa  308  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
315 aa  308  8e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.07 
 
 
316 aa  308  8e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.64 
 
 
319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.39 
 
 
311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.64 
 
 
319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
315 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
314 aa  306  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.91 
 
 
310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.42 
 
 
313 aa  305  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 
315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 
315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
312 aa  305  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
316 aa  305  6e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
315 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
313 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
313 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.18 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.38 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.24 
 
 
315 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
319 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.59 
 
 
310 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
323 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>