107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1662 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1662  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  972    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.174432 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1624  protein of unknown function DUF107  36.95 
 
 
478 aa  203  5e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  33.56 
 
 
423 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0020  hypothetical protein  29.58 
 
 
488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  29.91 
 
 
436 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  29.84 
 
 
458 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  30.84 
 
 
424 aa  137  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  27.29 
 
 
447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  30.7 
 
 
424 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0391  protein of unknown function DUF107  31.41 
 
 
452 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  29.48 
 
 
407 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  25.95 
 
 
828 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  30.62 
 
 
429 aa  103  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  28.86 
 
 
425 aa  93.6  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  27.31 
 
 
443 aa  89.7  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  26.54 
 
 
438 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  28.07 
 
 
472 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  24.94 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  30.15 
 
 
437 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  27.06 
 
 
453 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  27.45 
 
 
462 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  24.8 
 
 
463 aa  82  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  30.88 
 
 
503 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  27.81 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  26.71 
 
 
446 aa  79.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  26.91 
 
 
464 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  29.18 
 
 
557 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  27.88 
 
 
453 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  28.66 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  29.46 
 
 
560 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  27.89 
 
 
447 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  26.47 
 
 
508 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  29.14 
 
 
501 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  25.96 
 
 
455 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  25.72 
 
 
451 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  24.64 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  25.93 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  29.51 
 
 
472 aa  73.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  27.11 
 
 
458 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  24.64 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  24.81 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  25.6 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  28.36 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  28.73 
 
 
448 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  27.89 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  26.88 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  27.97 
 
 
433 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  29.38 
 
 
449 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  25 
 
 
496 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  28.83 
 
 
442 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  31.82 
 
 
428 aa  64.3  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  26.38 
 
 
423 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  25.23 
 
 
459 aa  63.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  24.67 
 
 
464 aa  63.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  27.27 
 
 
436 aa  63.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  25 
 
 
525 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0392  protein of unknown function DUF107  35.81 
 
 
170 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  26.28 
 
 
524 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  24.63 
 
 
470 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  29.63 
 
 
446 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  30.42 
 
 
472 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  27.27 
 
 
501 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  27.65 
 
 
481 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  25.87 
 
 
516 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  28.53 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  27.51 
 
 
430 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  30.29 
 
 
471 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  30 
 
 
471 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  35.16 
 
 
445 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0857  protein of unknown function DUF107  32.16 
 
 
255 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.925844  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0326  protein of unknown function DUF107  28.21 
 
 
206 aa  57.4  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0124428  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  26.5 
 
 
465 aa  57  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  25.14 
 
 
488 aa  56.6  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  27.35 
 
 
501 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  24.91 
 
 
519 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  24.91 
 
 
519 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  24.66 
 
 
529 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2598  hypothetical protein  28.41 
 
 
235 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  27.35 
 
 
501 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0037  nodulation efficiency protein NfeD  27.19 
 
 
452 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280773  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  23.81 
 
 
525 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  28.03 
 
 
427 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  25.1 
 
 
453 aa  54.7  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  25.66 
 
 
467 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  26.08 
 
 
467 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2900  protein of unknown function DUF107  31.08 
 
 
158 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0230935  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  25.31 
 
 
522 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  26.67 
 
 
438 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  26.56 
 
 
546 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  36.45 
 
 
510 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  29.07 
 
 
455 aa  51.2  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  26.05 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  27.7 
 
 
452 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  33.98 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  24.74 
 
 
528 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  23.27 
 
 
434 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  25.42 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  25.59 
 
 
443 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0553  putative lipoprotein  26.95 
 
 
443 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  38.83 
 
 
473 aa  47  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>