54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1646 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1646  protein of unknown function DUF883 ElaB  100 
 
 		 104 aa  211  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.689144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1241  protein of unknown function DUF883 ElaB  41.75 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00670421  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0878  protein of unknown function DUF883, ElaB  36.17 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255055  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1134  protein of unknown function DUF883 ElaB  35.48 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2150  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.69 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0675  protein of unknown function DUF883 ElaB  30 
 
 		 103 aa  50.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1933  hypothetical protein  31.58 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2676  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.470235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0843  hypothetical protein  31.58 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2067  hypothetical protein  31.58 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3240  transmembrane protein  31.58 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3187  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3225  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3378  hypothetical protein  34.41 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1387  hypothetical protein  30.53 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2440  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.58 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0015  putative transmembrane protein  29.91 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0870168  normal  0.721209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0692  protein of unknown function DUF883, ElaB  29.79 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0709  protein of unknown function DUF883 ElaB  29.79 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2572  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.85 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0774  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.58 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3906  hypothetical protein  31.58 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2485  hypothetical protein  30.84 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28490  hypothetical protein  31.91 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161534 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0811  protein of unknown function DUF883, ElaB  28.72 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865476  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0328  protein of unknown function DUF883, ElaB  28.72 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3904  protein of unknown function DUF883, ElaB  28.72 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0780  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.72 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  26.21 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  26.21 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3430  protein of unknown function DUF883 ElaB  27.55 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468728  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0523  hypothetical protein  32.39 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3263  hypothetical protein  28.71 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4413  hypothetical protein  28.71 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.319782 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02918  hypothetical protein  28.71 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0603  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.71 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3396  hypothetical protein  28.71 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0598  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.71 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.946971  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02967  hypothetical protein  28.71 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3571  hypothetical protein  28.71 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3286  hypothetical protein  28.71 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1647  protein of unknown function DUF883 ElaB  27.45 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266219  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0741  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.39 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3174  hypothetical protein  27.27 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3039  hypothetical protein  26.97 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000238513  normal  0.059368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3000  protein of unknown function DUF883, ElaB  25.47 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.876855  hitchhiker  0.0000209502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2568  hypothetical protein  27.47 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0124  hypothetical protein  26 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0547  protein of unknown function DUF883 ElaB  29.9 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0483  hypothetical protein  29.9 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0117535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1112  hypothetical protein  29.9 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0218952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3634  protein of unknown function DUF883, ElaB  27.45 
 
 		 104 aa  40  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.889919 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1714  hypothetical protein  46.15 
 
 		 91 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.314855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4328  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.39 
 
 		 101 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>