28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0795 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0795  S23 ribosomal protein  100 
 
 		 134 aa  273  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0366  S23 ribosomal protein  48.21 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00787101  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1133  S23 ribosomal protein  40.96 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0352  hypothetical protein  39.47 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50367  normal  0.137183 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1908  S23 ribosomal protein  43.06 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4754  S23 ribosomal protein  32.61 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.32042  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1776  S23 ribosomal protein  29.06 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353039  normal  0.0187612 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0797  hypothetical protein  32.23 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0834  S23 ribosomal protein  35.9 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.530691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3829  S23 ribosomal protein  30.85 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0815906  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0743  S23 ribosomal protein  32.47 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3825  hypothetical protein  29.31 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.169171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1793  hypothetical protein  40.79 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4875  S23 ribosomal protein  33.82 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1396  hypothetical protein  34.57 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2569  S23 ribosomal protein  29.82 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2144  hypothetical protein  29.55 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0702  hypothetical protein  28.4 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2842  hypothetical protein  26.56 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.578199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2263  hypothetical protein  33.67 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  decreased coverage  0.000429969 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2670  hypothetical protein  33.67 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1864  S23 ribosomal protein  44.68 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.508556  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0510  S23 ribosomal protein  34.25 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0653  hypothetical protein  28.4 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>