27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0396 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0396  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  100 
 
 
233 aa  461  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678517  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2519  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.33 
 
 
346 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0393  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.28 
 
 
416 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2427  FlgA family protein  30.16 
 
 
324 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1067  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  37.31 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0500277 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.69 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3157  FlgA family protein  28.46 
 
 
343 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.23 
 
 
347 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0595  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  35.96 
 
 
326 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.03 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0891  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 
258 aa  46.2  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.101452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2408  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.12 
 
 
316 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.85 
 
 
233 aa  45.1  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.85 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  30.22 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.48 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  29.69 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.71 
 
 
250 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4711  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  34.21 
 
 
343 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0269631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.55 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  30.26 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.55 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3280  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.8 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.81 
 
 
248 aa  42  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.72 
 
 
360 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3244  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.31 
 
 
348 aa  41.6  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.38 
 
 
252 aa  41.6  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>