96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4578 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009669  Oant_4578  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
335 aa  674    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3417  NMT1/THI5 like domain protein  59.33 
 
 
332 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3091  hypothetical protein  46.47 
 
 
362 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  27.98 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  28.78 
 
 
340 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  24.75 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  28.02 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.84 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.19 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  22.15 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  27.41 
 
 
349 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  27.41 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  27.18 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  23.51 
 
 
339 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.29 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  21.73 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  21.73 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  22.52 
 
 
328 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.97 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.97 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.61 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  21.97 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  21.97 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  21.66 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.97 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
340 aa  57  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3906  WD-40 repeat-containing protein  25.63 
 
 
343 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3168  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.63 
 
 
343 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3337  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.24 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181277  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0544  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.44 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.97989  normal  0.846557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.51 
 
 
345 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  25.65 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  22.31 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  20.47 
 
 
342 aa  53.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.34 
 
 
326 aa  52.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6053  NMT1/THI5 like domain protein  24.23 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  24.26 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.57 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
347 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.31 
 
 
339 aa  49.7  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  20.2 
 
 
360 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.22 
 
 
333 aa  49.3  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.95 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.65 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.33 
 
 
338 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2788  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.99 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0498257  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  25.56 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  20.65 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  23.65 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2516  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.5 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445481  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  28.57 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  23.31 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  30.77 
 
 
312 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3007  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  33.66 
 
 
322 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7861  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  25.93 
 
 
361 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.51 
 
 
329 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  26.51 
 
 
328 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  21.05 
 
 
356 aa  46.6  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  21.5 
 
 
331 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 
915 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7647  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic binding protein  27.54 
 
 
324 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1791  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  32.89 
 
 
329 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  26.07 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6342  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.97 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4036  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.67 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6519  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.97 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6753  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.97 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0691662 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  23.18 
 
 
794 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  22.54 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0115  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.77 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7503  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, aliphatic sulphonates  26.16 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.65 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3294  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  30.61 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0777  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  26.98 
 
 
341 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.54 
 
 
385 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  20.52 
 
 
322 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.49 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  31.91 
 
 
648 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  21.27 
 
 
375 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  32.61 
 
 
349 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  20.85 
 
 
327 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  23.87 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0851  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.43 
 
 
328 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0219644  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  29.58 
 
 
348 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0767  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  28.71 
 
 
322 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.250566 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  30.85 
 
 
647 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2895  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.06 
 
 
324 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.528553  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  23.21 
 
 
334 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  19.87 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  38.1 
 
 
346 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  21.94 
 
 
328 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.38 
 
 
347 aa  42.7  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  27.59 
 
 
346 aa  42.7  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>