More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1923 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1923  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 193 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1266  cold-shock family protein  94.82 
 
 		 193 aa  380  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.397552  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1228  cold-shock family protein  95.34 
 
 		 193 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.47 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0373427  hitchhiker  0.000349803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1733  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.63 
 
 		 197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2286  cold shock protein  72.28 
 
 		 192 aa  277  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00549771  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1550  cold-shock DNA-binding domain protein  67.88 
 
 		 192 aa  277  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1744  cold-shock DNA-binding domain protein  67.36 
 
 		 192 aa  275  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000196433  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1609  cold-shock protein, DNA-binding  67.61 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0789892  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2791  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.49 
 
 		 220 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190915  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0834  cold-shock DNA-binding family protein  65.73 
 
 		 179 aa  250  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.253832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4038  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.6 
 
 		 217 aa  250  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2142  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.05 
 
 		 217 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2938  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68 
 
 		 221 aa  247  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.645608  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2801  cold-shock DNA-binding domain protein  67.43 
 
 		 235 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2530  cold-shock DNA-binding domain protein  68 
 
 		 219 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2736  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65 
 
 		 201 aa  239  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.634457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0381  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.12 
 
 		 204 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.58799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1882  cold-shock DNA-binding domain protein  64.53 
 
 		 189 aa  235  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3196  cold-shock DNA-binding domain protein  61.36 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3232  cold-shock DNA-binding domain protein  60.8 
 
 		 181 aa  227  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4174  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64 
 
 		 192 aa  227  9e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524647  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3007  cold-shock protein DNA-binding  60.23 
 
 		 202 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0372335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0551  cold-shock DNA-binding domain protein  63.16 
 
 		 189 aa  214  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1552  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.26 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.786136  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2974  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.29 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42307 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.05 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2557  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.98 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.557959  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1498  cold-shock DNA-binding protein family protein  38.92 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.919918  normal  0.868857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2474  cold-shock DNA-binding protein family protein  38.99 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.251539  normal  0.0229175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1788  putative cold shock protein  38.51 
 
 		 173 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000033725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1149  cold-shock DNA-binding protein family protein  37.43 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000107907  normal  0.195461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2346  cold-shock DNA-binding protein family protein  39.24 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1021  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.24 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0436807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1053  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.12 
 
 		 180 aa  104  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0859  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0105  cold-shock DNA-binding domain protein  32.96 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.310654  normal  0.194385 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0538  cold-shock DNA-binding domain protein  35.4 
 
 		 217 aa  94.7  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1528  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  33.72 
 
 		 224 aa  90.5  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0346  cold-shock DNA-binding domain protein  30.34 
 
 		 242 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.631485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0192  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  31.84 
 
 		 241 aa  84.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2262  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 242 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0200  cold-shock DNA-binding domain protein  32.08 
 
 		 311 aa  78.6  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0333811  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3723  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  30.38 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0144  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  29.08 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3156  cold-shock DNA-binding domain protein  28.79 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04410  cold shock domain protein CspD  32.26 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3142  cold-shock DNA-binding protein family protein  34.06 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11906  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2344  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2279  cold-shock DNA-binding domain protein  27.51 
 
 		 310 aa  68.2  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.703886  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5798  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0312  cold-shock DNA-binding domain protein  30.32 
 
 		 418 aa  65.5  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.147611  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1185  cold shock protein CspA  38.81 
 
 		 67 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1032  cold shock protein  38.81 
 
 		 67 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000608124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1035  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.81 
 
 		 67 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000461706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1289  cold shock protein CspA  38.81 
 
 		 67 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4154  cold shock protein CspA  38.81 
 
 		 67 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1054  cold shock protein CspA  38.81 
 
 		 67 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1029  cold shock protein  38.81 
 
 		 67 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00447e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5340  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.94 
 
 		 83 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1135  cold shock protein CspA  38.81 
 
 		 67 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287991  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5581  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 67 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5816  major cold shock protein  42.42 
 
 		 67 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  35.29 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  35.29 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  35.29 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1213  cold shock protein CspA  38.81 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1232  cold shock protein CspA  37.31 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000325579  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4409  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3078  cold-shock DNA-binding domain protein  46.97 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  62  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  39.68 
 
 		 67 aa  62  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2256  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 68 aa  62  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  62  0.000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1475  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  35.29 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0855  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000708983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  35.29 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0493  hypothetical protein  37.68 
 
 		 77 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0469  hypothetical protein  37.68 
 
 		 77 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0942  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.76 
 
 		 71 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  39.06 
 
 		 67 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1449  cold-shock DNA-binding protein family protein  41.27 
 
 		 67 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0320  cold-shock DNA-binding protein family  40.91 
 
 		 68 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.673011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5524  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 67 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>