19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0212 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0212  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854615  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1927  hypothetical protein  40.88 
 
 
246 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3601  hypothetical protein  40.78 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3675  hypothetical protein  42.06 
 
 
162 aa  77  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2253  hypothetical protein  36 
 
 
339 aa  50.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215699  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2614  hypothetical protein  35.16 
 
 
329 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.4112  decreased coverage  0.00553167 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2800  hypothetical protein  30.68 
 
 
349 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.78052  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4451  hypothetical protein  31.82 
 
 
329 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000182249  unclonable  0.00000000157695 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2153  hypothetical protein  31.82 
 
 
329 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000696662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2279  hypothetical protein  28.71 
 
 
331 aa  40.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00859838  hitchhiker  4.1808499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3024  hypothetical protein  28 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1158  hypothetical protein  30.68 
 
 
349 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.53743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1522  hypothetical protein  30.68 
 
 
349 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1844  hypothetical protein  30.68 
 
 
349 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000141733  hitchhiker  0.0000000024539 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2199  hypothetical protein  30.68 
 
 
349 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000639622  hitchhiker  0.000000000128788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2268  hypothetical protein  30.68 
 
 
349 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.582934  hitchhiker  0.000000000247351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3155  hypothetical protein  30.68 
 
 
349 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000300414  hitchhiker  0.0000000000395416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1763  hypothetical protein  30.68 
 
 
348 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000197181  hitchhiker  0.00806436 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2477  hypothetical protein  28.71 
 
 
331 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  0.0132225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>