42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_93908 on replicon NC_009371
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009371  OSTLU_93908  predicted protein  100 
 
 		 280 aa  565  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.000312188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  26.43 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  21.98 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  21.98 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.58 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  26.77 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  27.64 
 
 		 367 aa  49.7  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  27.75 
 
 		 369 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.51 
 
 		 372 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0833  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23 
 
 		 364 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00162887  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4326  glycine cleavage system T protein  29.05 
 
 		 391 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.0579992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.38 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.34 
 
 		 380 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  28.93 
 
 		 351 aa  46.2  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3592  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.01 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3290  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.64 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3287  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.64 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.39 
 
 		 974 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3392  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.17 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.874381 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.67 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.61 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3225  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.47 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  27.78 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3213  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.47 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.26 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.05 
 
 		 379 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.67 
 
 		 366 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  24.02 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02700  hypothetical protein  25.47 
 
 		 364 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0787  glycine cleavage system T protein  25.47 
 
 		 364 aa  42.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.395738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3037  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.47 
 
 		 364 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.318867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0804  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.47 
 
 		 364 aa  42.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.47 
 
 		 364 aa  42.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.61058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3064  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.47 
 
 		 364 aa  42.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.47 
 
 		 364 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0166736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.67 
 
 		 366 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00861  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.01 
 
 		 359 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.67 
 
 		 366 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.67 
 
 		 366 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.06 
 
 		 376 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3151  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.26 
 
 		 364 aa  42.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000770906  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.05 
 
 		 375 aa  42.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>